本试验旨在探讨舍饲养殖对牦牛生长性能和瘤胃微生物物种组成及相对丰度、微生物碳水化合物酶(CAZy)以及蛋白质代谢通路的影响.选取2～3岁的健康雄性麦洼牦牛10只,体重在150～180 kg,采用完全随机试验设计,将其分为舍饲组和放牧组,每组5只,正试期为4个月.养殖结束后,每组5只牦牛进行屠宰,采集瘤胃液,提取DNA构建测序文库,采用宏基因组方法分析瘤胃微生物变化.结果 表明:与放牧养殖相比,舍饲养殖显著增加了麦洼牦牛的平均增重和平均日增重(P<0.05).瘤胃微生物基因预测共得到2065638个开放阅读框(ORFs),经去冗余后,共获得1571578个ORFs,其中完整基因数为333371个.与放牧养殖相比,舍饲组厚壁菌门、拟杆菌门、软壁菌门、浮霉菌门的相对丰度均增加(P>0.05),纤维杆菌门相对丰度显著下降(P<0.05);普雷沃氏菌属、梭菌属、拟杆菌属、丁酸弧菌属、假丁酸弧菌属、另枝菌属、产琥珀酸菌属相对丰度均增加(P>0.05),丝状杆菌属相对丰度显著下降(P<0.05).与放牧养殖相比,舍饲组糖苷水解酶(GH)、糖基转移酶(GT)相对丰度增加(P>0.05),且舍饲养殖对GT相对丰度的上调和碳水化合物结合模块(CBM)相对丰度的下调影响最大.此外,舍饲养殖还增加了瘤胃微生物转录、辅酶转运和代谢等功能蛋白的相对丰度(P>0.05),增加了碳水化合物代谢、氨基酸代谢和核苷酸代谢通路蛋白的相对丰度(P>0.05).综上所述,舍饲养殖显著增加了麦洼牦牛的体重,影响了牦牛瘤胃微生物的组成结构.
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