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克氏原螯虾内源性纤维素酶糖苷水解酶9基因家族鉴定及其表达分析

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本试验旨在分析鉴定克氏原螯虾内源性纤维素酶糖苷水解酶9(GH9)基因家族,研究其在投喂不同饲料时以及低氧-复氧胁迫下的表达特征,以期为克氏原螯虾对于植物性饲料的消化利用研究提供理论依据,同时为动物内源性纤维素酶高效利用研究积累数据资料.采用生物信息学与分子克隆相结合的策略,系统研究克氏原螯虾GH9基因家族的全基因组分布情况,获取克氏原螯虾GH9基因家族的结构特点、分布特征及其在投喂不同饲料(植物性饲料、动物性饲料、配合饲料)时以及低氧-复氧胁迫下的表达响应结果.结果显示:1)克氏原螯虾基因组中共有 7 个 GH9 基因家族成员(PcGH9-1、PcGH9-2、PcGH9-3、PcGH9-4、PcGH9-5、PcGH9-6、PcGH9-7),GH9基因家族成员的cDNA长度为1 843~2 354 bp,编码氨基酸残基数为510~585个,分布于LG23、LG39以及LG54等3条染色体上.克氏原螯虾GH9基因家族具有1个典型的Glyco hydro 9结构域,外显子数为7~14个,内含子数为6~13个.依据是否具有纤维素结合区(CBD),克氏原螯虾GH9基因家族可分为2个亚类,第Ⅰ亚类包括PcGH9-1、PcGH9-2和PcGH9-7,第 Ⅱ 亚类包括 PcGH9-3、PcGH9-4、PcGH9-5、PcGH9-6.2)克氏原螯虾 GH9 基因家族主要在肝胰腺中高表达.3)克氏原螯虾肝胰腺中GH9基因家族表达量及β-1,4-内切葡聚糖酶活性在投喂植物性饲料时最高,在投喂动物性饲料时最低.4)低氧-复氧胁迫下,克氏原螯虾肝胰腺中PcGH9-1、PcGH9-2、PcGH9-3、PcGH9-4与PcGH9-5的表达量随着低氧胁迫时间延长而下降,PcGH9-6与PcGH9-7的表达量在低氧-复氧胁迫下变化较小;低氧-复氧胁迫下,β-1,4-内切葡聚糖酶活性随着低氧胁迫时间延长而显著下降(P<0.05).综上可知,克氏原螯虾体内具有内源性纤维素酶GH9基因家族,GH9基因家族成员主要在肝胰腺中高表达.投喂植物性饲料可显著提升克氏原螯虾肝胰腺组织中GH9基因家族的表达及β-1,4-内切葡聚糖酶活性,低氧-复氧胁迫可显著抑制GH9基因家族表达及β-1,4-内切葡聚糖酶活性.
Identification and Expression Analysis of Endogenous Cellulase Glycoside Hydrolase 9 Gene Family in Procambarus clarkii

王霆辉、李旭光、徐宇、李佳佳、王爱民、明建华、许志强

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湖州师范学院生命科学学院,湖州313000

江苏省淡水水产研究所,农业农村部淡水虾蟹遗传育种与养殖重点实验室,南京210017

盐城工学院海洋与生命科学院,盐城224000

克氏原螯虾 GH9基因家族 β-1,4-内切葡聚糖酶 不同饲料 低氧胁迫

江苏省种业振兴"揭榜挂帅"项目江苏现代农业重点项目江苏省农业科技自主创新资金项目

JBGS[2021]032BE2020348CX213176

2023

动物营养学报
中国畜牧兽医学会

动物营养学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子:1.297
ISSN:1006-267X
年,卷(期):2023.35(3)
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