本试验旨在研究断奶马驹十二指肠、空肠和回肠菌群的多样性,为全面评价断奶后马属动物小肠发育、健康、功能等提供参考依据.选取6匹平均体重为(147.08±4.86)kg的哈萨克断奶马驹为研究对象,在相同的饲养管理和饲粮营养水平条件下饲养60 d.采集断奶马驹十二指肠、空肠和回肠的内容物,采用16S rRNA高通量测序技术检测各肠段内容物中菌群的多样性.结果显示:1)断奶马驹十二指肠菌群的ACE指数和PD_whole_tree指数均显著高于空肠(P＜0.05).2)在门水平上,厚壁菌门是十二指肠、空肠和回肠中最主要的优势菌,其次是变形菌门和拟杆菌门,其中空肠中厚壁菌门的相对丰度比回肠提高了 26.98％(P＜0.05),回肠菌群中变形菌门和梭杆菌门的相对丰度显著或极显著高于十二指肠和空肠(P＜0.05或P＜0.01).在科水平上,回肠中肠杆菌科和巴斯德氏菌科的相对丰度均显著高于空肠(P＜0.05),且巴斯德氏菌科的相对丰度还显著高于十二指肠(P＜0.05);十二指肠中瘤胃球菌科的相对丰度较空肠提高了 156.04％(P＜0.05).在属水平上,回肠中肠杆菌科未鉴定属的相对丰度显著高于空肠(P＜0.05),放线杆菌属的相对丰度显著高于空肠和十二指肠(P＜0.05).3)LEfSe分析显示空肠菌群中有显著差异的物种有4种,回肠菌群中有显著差异的物种有6种.Tax4Fun功能预测分析显示,断奶马驹十二指肠、空肠和回肠菌群的主要功能存在明显差异.综上所述,断奶马驹十二指肠、空肠和回肠中菌群结构存在明显差异,十二指肠和空肠中主要以厚壁菌门及隶属于厚壁菌门的细菌为主,回肠中则主要以厚壁菌门和变形菌门的细菌为主.
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