首页|杨梅侧生器官边界域基因组鉴定及进化分析

杨梅侧生器官边界域基因组鉴定及进化分析

扫码查看
原文链接
  • 国家科技期刊平台
  • NETL
  • NSTL
  • 万方数据
  • 维普
为探究杨梅侧生器官边界域基因(LBD)在杨梅全基因组中的数量和结构,利用杨梅最新基因组的数据,结合生物信息学的方法对基因蛋白进行结构、系统进化和共线性分析,对杨梅LBD基因家族进行了鉴定,并分析其分子质量和等电点,为今后研究LBD基因家族在杨梅成长过程和逆境调节中的详细功能奠定基础.结果表明,从杨梅基因组中共鉴定出33个杨梅LBD(MrLBD)基因,根据染色体分布对其进行重命名.根据其LBD结构域和系统进化树分析的特征,杨梅LBD家族基因分为ClassⅠ和ClassⅡ两类,各有28个和5个LBD基因.杨梅LBD家族基因的结构并不复杂,其中内含子总数不超过2.在对保守域的研究中,通过对LBD基因进行亚细胞定位、三级结构的同源建模和种内与种间共线性分析,发现同一组的基因往往具有相似的外显子-内含子、基序和蛋白质结构.
Genomic identification and evolutionary analysis of the boundary domain of lateral organs in Myrica rubra

梁健翔、吴进樟、张尧、曹世江

展开 >

福建农林大学林学院,福建 福州350002

杨梅 侧生器官边界域基因组 系统进化分析 转录因子 生物信息学

国家自然科学基金福建农林大学高峰学科项目

3160022871201800739

2021

10.13324/j.cnki.jfcf.2021.02.008

森林与环境学报
福建农林大学

森林与环境学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：0.964
ISSN：2096-0018
年,卷(期)：2021.41(2)
  • 9