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泡桐丛枝病相关microRNAs测序及其靶基因预测

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为探讨microRNAs(miRNAs)在泡桐丛枝病发生过程中的作用,选取白花泡桐、毛泡桐及豫杂一号泡桐的健康苗、丛枝病苗和甲基磺酸甲酯(MMS)处理恢复健康状态的丛枝病苗作为试验材料,利用高通量测序平台及生物信息学分析技术,筛选与泡桐丛枝病发生相关的miRNAs及其靶基因.结果共鉴定出546个miRNAs,并筛选出11个差异表达且与泡桐丛枝病发生相关的miRNAs,降解组测序发现其中7个miRNAs调控29个靶基因.由蛋白互作网络分析可知,这些泡桐丛枝病发生相关miRNAs协同发挥作用,参与泡桐的防御反应、光合作用和激素合成等生物学过程.研究结果为揭示miRNAs在泡桐丛枝病发生过程中的作用机制提供了一定的研究基础.
Identification of the microRNAs and their target genes related to Paulownia witches′broom phytoplasma

王利美、邓敏捷、张艳芳、程智远、李熙尧、范国强

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河南农业大学泡桐研究所,河南 郑州450002

泡桐 泡桐丛枝病 microRNAs 高通量测序 靶基因

中原学者科学家工作室建设专项

豫科[2018]185

2021

10.13324/j.cnki.jfcf.2021.02.009

森林与环境学报
福建农林大学

森林与环境学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：0.964
ISSN：2096-0018
年,卷(期)：2021.41(2)
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