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桑黄9个萜类合成酶基因的鉴定及表达分析

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为了解高等药用真菌桑黄的萜类合成酶(TPS)基因的功能,从桑黄全基因组中分离获得TPS基因,并对其进行生物信息学分析、系统发育树构建,分析其在不同碳源和氮源培养条件下的表达情况.结果表明:在桑黄基因组中分离出9个SsTPS基因,除SsTPS2蛋白质没有特征基序外,其余SsTPS蛋白质均具有TPS的典型特征基序;二级结构以α-螺旋和无规则卷曲为主.9个SsTPS聚为2个支系,初步推测SsTPS1为倍半萜合成酶,且可以催化合成α-muurolene;SsTPS3、SsTPS4、SsTPS5、SsTPS9属于倍半萜合成酶,SsTPS3和SsTPS5合成δ-cadinene的类似物或衍生物,SsTPS4和SsTPS9分别合成β-copaene、α-muurolene的类似物或衍生物;SsTPS2为三萜合成酶.SsTPS1、SsTPS4、SsTPS6基因在所有培养基中均不表达,其余基因呈现差异化表达,SsTPS7仅在添加肌醇为碳源、大豆蛋白粉为氮源的培养基中低量表达;SsTPS2、SsTPS3、SsTPS5、SsTPS8、SsTPS9分别在添加果糖为碳源、大豆蛋白粉为氮源、牛肉浸粉为氮源、酵母粉为氮源、香蕉粉为氮源的培养基中表达量最高.基因簇分析显示,SsTPS1和SsTPS4编码基因所在contig有基因簇的存在.
Identification and expression analysis of nine terpene synthase genes in Sanghuangporus sanghuang

李云琴、王毅、张子蕴、原晓龙、杨焱、杨文忠

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云南省林业和草原科学院,云南 昆明650201

云南省森林植物培育与开发利用重点实验室,国家林草局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室,云南 昆明650201

上海市农业科学院食用菌研究所,上海201106

桑黄 萜类合成酶 生物信息学分析 基因表达

国家自然科学基金云南省应用基础研究计划面上项目2019中央引导地方发展专项基金云南省林业和草原科学院创新基金

318601772021FB218MS2019-09

2021

森林与环境学报
福建农林大学

森林与环境学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子:0.964
ISSN:2096-0018
年,卷(期):2021.41(4)
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