森林与环境学报2023,Vol.43Issue(1) :60-67.DOI:10.13324/j.cnki.jfcf.2023.01.008

锥栗MADS-box基因家族鉴定及组织特异性表达分析

Identification of the MADS-box gene family and its tissue-specific expression in Castanea henryi

余玉云 沈军 柳明珠 罗开金 陈世品
森林与环境学报2023,Vol.43Issue(1) :60-67.DOI:10.13324/j.cnki.jfcf.2023.01.008

锥栗MADS-box基因家族鉴定及组织特异性表达分析

Identification of the MADS-box gene family and its tissue-specific expression in Castanea henryi

余玉云 1沈军 1柳明珠 1罗开金 1陈世品1
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作者信息

  • 1. 福建农林大学林学院,福建 福州350002
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摘要

为研究MADS-box基因家族在锥栗花和果实发育过程中的作用,在锥栗全基因组水平上,用生物信息学方法对其MADS-box基因家族进行鉴定、理化性质分析、系统进化分析和染色体定位,分析其基因复制、基因结构、顺式作用元件和表达量.结果表明,锥栗基因组中存在60个ChMADS-box基因,不均匀地分布在除了2号染色体(Chr2)外的11条染色体上,其中,存在4对串联重复和8对片段重复.根据系统发育关系,可将锥栗基因组的60个ChMADS-box基因分为type-Ⅰ型(20个)和type-Ⅱ型(40个).ChMADS-box蛋白均含有MADS结构域(Motif1和Motif2),且同亚家族基因显示出相似的基因结构.ChMADS-box基因的启动子区域含有植物生长、光反应、激素反应和胁迫反应等顺式作用元件.ChMADS-box基因在叶、雄花、雌花、果实和壳斗5种组织中具有特异性表达模式,表明其在植物生长发育过程中具有不同的功能.在果实和雄花发育的3个过程中,ChMADS17、ChMADS22、ChMADS30、ChMADS32、ChMADS36、ChMADS43、ChMADS49、ChMADS53表达较高,表明它们在锥栗花和果实发育过程中起到重要作用.

关键词

锥栗/MADS-box基因家族/全基因组鉴定/生物信息学/组织特异性/表达分析

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基金项目

福建农林大学林学高峰学科建设项目(72202200205)

出版年

2023
森林与环境学报
福建农林大学

森林与环境学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子:0.964
ISSN:2096-0018
被引量3
参考文献量10
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