森林与环境学报2023,Vol.43Issue(3) :303-310.DOI:10.13324/j.cnki.jfcf.2023.03.011

圆齿野鸦椿YABBY基因家族鉴定及功能分析

Identification and functional analysis of the YABBY gene family in Euscaphis konishii

陈淑颖 李一凡 曾伟伟 李金燃 高艺闻 邹双全
森林与环境学报2023,Vol.43Issue(3) :303-310.DOI:10.13324/j.cnki.jfcf.2023.03.011

圆齿野鸦椿YABBY基因家族鉴定及功能分析

Identification and functional analysis of the YABBY gene family in Euscaphis konishii

陈淑颖 1李一凡 1曾伟伟 1李金燃 1高艺闻 2邹双全1
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作者信息

  • 1. 福建农林大学林学院,福建 福州350002;自然生物资源保育利用福建省高校工程技术研究中心,福建 福州350002
  • 2. 福建农林大学林学院,福建 福州350002
  • 折叠

摘要

YABBY基因家族在叶片、花器官、果实等生长发育方面具有调节功能.为了明确圆齿野鸦椿YABBY基因家族成员的基本特征,利用生物信息学手段对圆齿野鸦椿YABBY基因家族进行鉴定及功能分析.结果表明:在圆齿野鸦椿基因组中共鉴定出9个YABBY基因,非均匀分布在5条染色体上,通过系统发育树将其划分为5个亚族:FIL/YAB3、INO、YAB2、YAB5和CRC,多数基因有8个内含子.圆齿野鸦椿YABBY基因家族的主要扩增方式为片段复制.圆齿野鸦椿YABBY基因家族的表达具有组织特异性,EkYABBY3、EkYABBY7和EkYABBY8分别在胚胎、雌蕊和雄蕊进行了高表达,EkYABBY9在花蕾和花瓣+萼片上进行了低表达,在其他组织进行了高表达.YABBY基因启动子2000 bp处含有多个非生物胁迫响应和激素响应元件,如光响应元件、赤霉素响应元件.圆齿野鸦椿种子发芽率低且具有深休眠现象,研究发现INO类基因和YAB2类基因在其种子发育过程中发挥重要作用,本研究结果为进一步深入研究YABBY基因家族对圆齿野鸦椿种子发育的生物学功能提供科学依据.

关键词

圆齿野鸦椿/YABBY基因家族/生物信息学/系统进化分析

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基金项目

福建省科技厅高校产学合作项目(2020N5004)

福建省科技厅引导性项目(2022Y0043)

出版年

2023
森林与环境学报
福建农林大学

森林与环境学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子:0.964
ISSN:2096-0018
参考文献量10
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