森林与环境学报2024,Vol.44Issue(1) :95-104.DOI:10.13324/j.cnki.jfcf.2024.01.012

柳杉毛虫JHBP家族基因鉴定及生物信息学分析

Identification and biological analysis of JHBP gene family members within Dendrolimus houi

叶淑婷 陈祯鸿 赵真辉 何欢 林孝春 梁光红
森林与环境学报2024,Vol.44Issue(1) :95-104.DOI:10.13324/j.cnki.jfcf.2024.01.012

柳杉毛虫JHBP家族基因鉴定及生物信息学分析

Identification and biological analysis of JHBP gene family members within Dendrolimus houi

叶淑婷 1陈祯鸿 1赵真辉 1何欢 1林孝春 2梁光红1
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作者信息

  • 1. 福建农林大学林学院, 福建 福州350002
  • 2. 福鼎市林业局, 福建 福鼎355200
  • 折叠

摘要

研究我国林业重要食叶害虫——柳杉毛虫保幼激素结合蛋白(JHBP),对于揭示其生长发育、化蛹、摄食、交配生殖及抗药性等生命活动具有重要意义.参照模式昆虫家蚕的41条JHBP蛋白序列,构建系统进化树,并对这些基因所编码的蛋白质二级结构、疏水性、蛋白质序列基序和三级结构等生物学特性进行分析,利用heatmap可视化工具分析柳杉毛虫JHBP在不同发育时期的表达水平.结果表明,柳杉毛虫JHBP基因共有JHBPa、JHBPc、JHBPd 3个亚家族,分别包含6、26、15个JHBP基因;蛋白序列至少含有1个JHBP结构域,且其中Dho05G001220蛋白序列不仅含有JHBP结构域,还含有Grp_allergen结构域,各蛋白序列的疏水性区域呈明显的聚集分布,亲水性区域的聚集分布则不明显;JHBP基因在柳杉毛虫的低龄和中龄幼虫、蛹和成虫中显著表达,表明JHBP明显参与调控不同虫态的发育或变态过程.研究结果可为进一步明确柳杉毛虫JHBP基因家族的生物学功能提供参考.

关键词

柳杉毛虫/基因家族/JHBP/生物信息学分析

Key words

Dendrolimus houi/gene families/Juvenile hormone binding protein/bioinformatic analyses

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基金项目

福建省科技厅引导性项目(2021N0002)

福建省林业科技推广项目(2023TG16)

福州市林业科学研究项目(榕财农指[2022]81号)

出版年

2024
森林与环境学报
福建农林大学

森林与环境学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子:0.964
ISSN:2096-0018
参考文献量8
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