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怀玉山三叶青2个栽培种块根的转录组分析

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[目的]筛选怀玉山三叶青2个栽培种:怀玉1号(HY1组)和怀玉2号(HY2组)与黄酮类化合物合成相关差异表达基因.[方法]以怀玉山三叶青怀玉1号(HY1组)和怀玉2号(HY2组)的块根为试验材料进行转录组分析.[结果]HY1组和HY2组的Clean reads分别为42311662和41411202.2组样品Q30碱基百分比均不小于95.75％.HY1组和HY2组的转录因子家族多为MYB-superfamily、bHLH、AP2/ERF、NAC、C2C2、WRKY等.HY1组和HY2组表达量FPKM的对数值在0-2.HY1组和HY2组表达量密度在0-0.7.HY1组和HY2组表达的共有基因数为22367,HY1组单独表达的基因数为18196,HY2组单独表达的基因数为8137.HY1组和HY2组表达量的相关系数为0.913,样本间相关性好.HY1组和HY2组共产生差异表达基因12199个.与HY1组比较,HY2组上调基因数为3551,下调基因数为8648.GO富集分析显示,差异基因主要注释到光合作用光系统I光捕获、光合作用捕获、叶绿素代谢过程、蛋白质发色团连锁、前体代谢产物和能量的产生、叶绿素生物合成过程、氧化应激反应、α-氨基酸代谢过程、光合作用、质体小叶、光系统I、光系统II、质体类核仁、光系统、叶绿素结合、单加氧酶活性、铁离子结合、血红素结合、裂解酶活性功能.KEGG富集分析显示,差异基因主要注释到光合作用-天线蛋白、核糖体、乙醛酸和二元酸代谢、苯丙酸生物合成、二苯乙烯类、二芳基庚烷类和姜辣素的生物合成、类黄酮生物合成、光合作用、光合生物的固碳作用、甘氨酸、丝氨酸和苏氨酸代谢、植物激素信号转导、谷胱甘肽代谢、丙酮酸代谢、苯丙氨酸代谢、植物昼夜节律、黄酮和黄酮醇的生物合成、半胱氨酸与蛋氨酸代谢、氰胺酸代谢、类胡萝卜素生物合成、α-亚麻酸代谢、卟啉与叶绿素代谢等代谢途径.[结论]与黄酮类化合物相关差异表达基因如芪合酶(stilbene synthase)、无色花色素双加氧酶(leucoanthocyanidin dioxygenase)、查尔酮异构酶蛋白(CHI protein)、查尔酮合酶2(chalcone synthase 2)、黄烷酮3-羟化酶(flavanone 3-hydroxylase)、无色花色素还原酶(1leucoanthocyanidin reductase 1)、类黄酮3'-羟化酶(flavonoid 3'-hydroxylase)基因在怀玉2号(HY2组)块根中上调,而查尔酮合酶(chalcone synthase)、黄酮醇合酶(flavonol synthase)、类黄酮3',5'-甲基转移酶(flavonoid 3', 5'-methyltransferase)基因在怀玉2号(HY2组)块根中下调,导致怀玉山三叶青怀玉1号(HY1组)和怀玉2号(HY2组)块根总黄酮含量的差异.
Transcriptome Analysis on Tubers of Two Huaiyushan Cultivated Varieties of Tetrastigma hemsleyanum

洪森荣、黄丹丹、黄诗慧、黄夏梦、蒋椰、李万平、蔡红、陈荣华

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上饶师范学院生命科学学院,江西 上饶 334001

上饶市药食同源植物资源保护与利用重点实验室,江西 上饶 334001

上饶市三叶青保育与利用技术创新中心,江西 上饶 334001

上饶农业技术创新研究院,江西 上饶 334001

上饶市红日农业开发有限公司,江西 上饶 334700

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怀玉山三叶青 栽培种 块根 转录组分析

国家自然科学基金江西省科技厅重点研发计划一般项目江西省科技厅重点研发计划一般项目江西省教育厅科学技术研究项目上饶市科技局重点研发计划一般项目上饶市科技局平台载体建设项目上饶市科技局平台载体建设项目

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2021

10.19303/j.issn.1008-0384.2021.01.004

福建农业学报
福建省农业科学院

福建农业学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：0.656
ISSN：1008-0384
年,卷(期)：2021.36(1)
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