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利用BSA-Seq方法鉴定谷丰B抗稻瘟病基因

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[目的]挖掘和鉴定谷丰B稻瘟病抗性基因,了解谷丰B稻瘟病抗性遗传模式.[方法]以谷丰B和日本晴杂交获得F1和F2代遗传群体,接种稻瘟菌不同生理小种并分析抗病遗传模式;在F2群体中挑选极端抗/感单株构建DNA混合池,利用群体分离分析法(BSA)定位关联区域.[结果]谷丰B对KJ201、RB22、CHNOS、RB6、2Y838-1、501-3和IR16-1等菌株均表现高抗性,表明谷丰B基因组可能携带了广谱高抗稻瘟病基因.谷丰B和日本晴杂交,F1群体表现抗501-3和IR16-1,F2群体的抗病/感病分离比不符合3:1,推测谷丰B基因组存在多个位点影响稻瘟病抗性.对F2群体的极端抗病、感病混合池及亲本DNA进行全基因组测序,鉴定了1756964个单核苷酸多态性(SNPs)标记.分析子代△SNP-index,定位到2个与抗病性显著关联区间,分别为Chr.6: 10082-11397 kb和Chr.11: 120-266 kb.其中,6号染色体的关联区间与Pi2/9抗病位点等位,区间内含有4006个SNPs和623个插入缺失(InDels)标记;11号染色体的关联区间含有752个SNPs和195个InDels标记.[结论]谷丰B对强致病力501-3菌株抗性可能是由第6号和11号染色体上的基因共同控制.研究结果为谷丰B抗性基因的精细定位及基因克隆奠定了基础,并为水稻抗稻瘟病分子标记辅助选择提供标记资源.
BSA-Seq Identification of Blast-resistance Genes in Gufeng B Rice

陈子强、陈松彪、郭新睿、颜静宛、田大刚、李刚、王锋

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福建省农业遗传工程重点实验室/福建省农业科学院生物技术研究所,福建 福州 350003

闽江学院海洋研究所海洋与农业生物技术实验室,福建 福州 350108

水稻 稻瘟病 抗性基因 谷丰B BSA

福建省科技计划公益类专项福建省自然科学基金

2018R1019-92017J01054

2021

福建农业学报
福建省农业科学院

福建农业学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子:0.656
ISSN:1008-0384
年,卷(期):2021.36(1)
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