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胡椒PnPAL基因家族全基因组鉴定及表达模式分析

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[目的]胡椒瘟病是影响胡椒产量的第一大病害,胡椒苯丙氨酸解氨酶(PnPAL)基因是胡椒抗瘟病的关键基因.探明胡椒PnPAL基因家族的基本特征、进化关系及表达模式,以便于其功能研究.[方法]通过全基因组查找、鉴定得到14条胡椒PnPAL家族成员,分别命名为PnPAL1～PnPAL14,并对这14条序列进行生物信息学及表达模式分析.[结果]蛋白质基本信息分析显示,该家族理论等电点在5.76～9.77,分子量在7.37441～83.43107 kDa.有7条胡椒的PnPAL基因含有8个motif和PLN02457保守结构域,该7条胡椒PnPAL家族成员被进一步鉴定为胡椒PnPAL家族成员.胡椒PnPAL家族成员含有诸多胁迫响应元件,特别是水杨酸、茉莉酸甲酯等与抵抗病原入侵的顺式作用元件.胡椒的PnPAL基因位于系统发生树基部位置,表明胡椒的PnPAL基因较为古老,与胡椒的系统地位相似.表达模式分析显示,PnPAL10在受病原诱导后基本呈上调趋势,表明PnPAL10可能是胡椒抗瘟病的关键基因.[结论]对胡椒PnPAL基因家族开展了生物信息学及表达模式分析,证明其在抗瘟病中的潜在作用,筛选到关键家族成员PnPAL3.
Whole-genome Identification and Bioinformatics of PnPAL Family in Black Peppers

苏岳峰、丁元昊、郝朝运、胡丽松、郑其向、范睿

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海南大学,海南 海口 570208

中国热带农业科学院香料饮料研究所,海南 万宁 571533

云南农业大学热带作物学院,云南 普洱 665000

胡椒 苯丙氨酸解氨酶(PAL) 生物信息

316016261630142020001

2021

10.19303/j.issn.1008-0384.2021.06.001

福建农业学报
福建省农业科学院

福建农业学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：0.656
ISSN：1008-0384
年,卷(期)：2021.36(6)
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