首页|茶树MYC转录因子家族的全基因组鉴定及表达分析

茶树MYC转录因子家族的全基因组鉴定及表达分析

扫码查看
原文链接
  • 国家科技期刊平台
  • NETL
  • NSTL
  • 万方数据
  • 维普
[目的] 髓细胞组织增生蛋白(Myelocytomatosis proteins,MYC)是植物茉莉酸信号转导途径中的重要转录因子.鉴定并分析茶树MYC转录因子有助于了解其潜在的分子机制.[方法] 采用生物信息学方法,对茶树CsMYC转录因子进行全基因组范围内的鉴定与分析.[结果] 从茶树基因组中总共鉴定出9个CsMYC成员,分布在茶树的5条染色体上.系统进化分析表明植物MYC家族可能起源于陆生植物并发生了谱系特异性分化事件.结构分析表明该家族内含子数目为0～3个,说明该家族在进化过程中发生内含子丢失事件.茶树8个MYC成员能在双子叶植物葡萄中找到同源基因.茶树不同组织转录组分析表明,除了CsMYC2和CsMYC9外,其他成员在芽和叶中表达量较高;荧光定量结果表明,所有成员均响应茉莉酸胁迫处理,同时个别成员也响应干旱、低温和赤霉素处理.使用皮尔森相关系数对与CsMYCs各成员表达量显著相关的基因集进行KEGG功能富集分析表明CsMYCs广泛参与了茶树次级代谢相关途径.[结论] 本研究共鉴定出9个CsMYC成员,分析并预测了其结构及潜在分子功能.结合实时荧光定量和功能富集分析表明CsMYC家族在茶树非生物胁迫响应中扮演了重要角色.
Genome-wide Analysis and Expression Pattern of MYC Family in Camellia sinensis

郑玉成、谷梦雅、毕婉君、胡清财、王鹏杰、叶乃兴、孙云

展开 >

福建农林大学园艺学院/茶学福建省高校重点实验室,福建 福州 350002

茶树 MYC基因家族 茉莉酸信号转导途径 表达分析

国家现代农业(茶叶)产业技术体系建设专项福建省"2011协同创新中心"中国乌龙茶产业协同创新中心专项福建农林大学茶产业链科技创新与服务体系建设项目

CARS-19闽教科 201575号K1520005A06

2021

福建农业学报
福建省农业科学院

福建农业学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：0.656
ISSN：1008-0384
年,卷(期)：2021.36(9)
  • 3
  • 1