首页|8个番石榴品种的转录组测序

8个番石榴品种的转录组测序

扫码查看
原文链接
  • 国家科技期刊平台
  • NETL
  • NSTL
  • 万方数据
  • 维普
[目的]获得番石榴转录本数据,探讨不同番石榴品种转录本之间差异.[方法]研究通过Illumina HiSeq 2500平台对红心(HX)、彩虹(CH)、紫红(ZH)、水晶(SJ)、秀珍(XZ)、彩叶变(CYB)、彩叶(CY)和紫星(ZX)等8个番石榴品种的8～9成熟果肉进行转录组测序,通过组装及数据库比对,获得大量番石榴转录本注释信息.[结果]组装获得了126979条Unigene,平均长度766 bp,N50为1654 bp,N90为267 bp;8个番石榴品种间共有27274个基因为共表达基因.通过主成分分析与差异基因表达聚类分析,发现品种水晶(SJ)和彩叶变(CYB)之间基因功能表达差异较小,品种紫红(ZH)与其他品种之间基因表达差异较大.聚类分析将品种水晶(SJ)和彩叶变(CYB)聚为一类,品种红心(HX)、彩虹(CH)、秀珍(XZ)、彩叶(CY)、紫星(ZX)归为一类,但品种紫红(ZH)与其他品种间距离较远.[结论]本研究结果为后续番石榴种质资源分类、功能基因表达、功能基因鉴定提供了大量可靠的转录组数据.
Transcriptome Sequencing on Eight Psidium guajava Cultivars

张丽梅、陈钟佃、张朝坤、魏秀清、许家辉

展开 >

福建省农业科学院果树研究所,福建 福州 350013

福建省农业科学院农业生态研究所,福建 福州350013

福建省漳州市农业科学研究所,福建 漳州 363000

番石榴 转录组 测序 功能注释

福建省农科院科技创新团队项目中国热带农科院基本科研业务费专项福建省科技计划区域发展项目

CXTD2021008-216300320200132016N3021

2021

10.19303/j.issn.1008-0384.2021.11.008

福建农业学报
福建省农业科学院

福建农业学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：0.656
ISSN：1008-0384
年,卷(期)：2021.36(11)
  • 2
  • 5