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4份临床样品中羊口疮病毒F1L、B2L和GIF基因的进化分析

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[目的] 研究2021年福建省部分羊场羊口疮病毒(Orf virus, ORFV)分子流行病学情况.[方法] 对2021年采集的4份病料经PCR鉴定ORFV阳性的临床样品分别克隆其F1L、B2L和GIF基因,将获得的克隆质粒送往测序公司进行测序,将测序拼接后的序列上传至GenBank数据库中,利用生物信息学软件进行对比分析.[结果] 4份临床样品中ORFV的F1L、B2L和GIF基因核苷酸序列相似性分别为98.0％～98.8％、98.4％～99.5％和97.2％～99.6％;与国内流行毒株核苷酸序列相似性分别为97.4％～99.4％、97.4％～99.9％和95.7％～99.0％;与国外流行毒株核苷酸序列相似性分别为97.5％～98.6％、97.9％～98.9％和95.6％～98.0％;与德国D1701弱毒株核苷酸序列相似性分别为96.5％～96.8％、98.0％～98.7％和96.0％～96.4％,与NZ2参考株核苷酸序列相似性分别为97.7％～98.1％、97.5％～98.1％和95.9％～96.1％.遗传进化树结果显示4份临床样品中ORFV与吉林(NA17、SY17和CL18株)、福建SJ1株和印度MP株亲缘关系较近;与美国OV-IA82株、德国D1701弱毒株、新西兰NZ2参考株和中国疫苗株亲缘关系较远;表明当前流行毒株可能是本省毒株、国内吉林GZ18株和国外印度MP株的重组毒株.[结论] 获得4份临床样品中ORFV B2L、F1L和GIF基因序列并上传至GenBank数据库中,丰富了ORFV相关基因序列的数据库,同时阐明福建省部分羊场当前ORFV的流行特征,为福建省今后有效防控Orf提供理论依据.
Genetic Evolution of F1L, B2L, and GIF of Orf Virus in Four Clinical Samples

林裕胜、刘维巍、张龙、江锦秀、张靖鹏、刘庆华、胡奇林

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福建省农业科学院畜牧兽医研究所,福建 福州 350013

福建农林大学动物科学学院,福建 福州 350002

羊口疮病毒 F1L基因 B2L基因 GIF基因 进化分析

XTCXGC20210082021R10260072021J01484CXTD2021007-2

2022

10.19303/j.issn.1008-0384.2022.06.009

福建农业学报
福建省农业科学院

福建农业学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：0.656
ISSN：1008-0384
年,卷(期)：2022.37(6)
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