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家蚕茧层率相关基因筛选及其功能分析

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[目的]挖掘家蚕茧层率相关基因,以期为家蚕茧层率性状分子遗传改良提供参考依据.[方法]以多丝量家蚕品种菁松和中丝量家蚕品种芙蓉为亲本构建BC1代分离群体.在BC1代雄性群体中挑选极端高/低茧层率个体构建子代DNA混池,运用BSA-seq方法对茧层率关联区域进行定位,并运用BLAST软件对关联区域的编码基因进行GO和KEGG等数据库注释及功能预测.[结果]重测序数据与家蚕参考基因组平均比对率为98.86％,平均基因组覆盖度为95.79％(1×)和88.63％(5×);变异检测共获得26 557 646个SNPs;∆(SNP-index)定位到3个与茧层率显著相关的区域,分别为Chr.2:4 430～4 930 kb、Chr.4:12 350～12 920 kb和Chr.13:3 230～3 730 kb,共包含70个编码基因.通过GO与KEGG注释,有58个基因注释到GO数据库,涉及生物过程、分子功能和细胞组分三大类;有19个基因注释到KEGG通路,分布于34个代谢通路中.通过KEGG代谢通路分析,筛选出10个可能对家蚕茧层率有重要调控作用的基因,推测其参与了家蚕丝腺细胞运动、能量代谢和蛋白质合成加工.[结论]运用BSA-seq方法在家蚕第2、4和13号染色体上定位到与茧层率关联的区域,筛选到10个可能与茧层率密切相关的候选基因,为茧层率关键调控基因精细定位及克隆奠定基础.
Identification and Functional Analysis of Genes Related to Cocoon Shell Ratio in Bombyx mori

任晓晓、孙运朋、卿卓、杨万军、罗朝斌

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贵州省农业科学院蚕业研究所,贵州 贵阳 550006

家蚕 茧层率 BSA-seq 基因注释

黔科合基础[2020]1Y133黔科合成果[2019]4214黔农科院青年科技基金[2020]09

2022

10.19303/j.issn.1008-0384.2022.007.004

福建农业学报
福建省农业科学院

福建农业学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：0.656
ISSN：1008-0384
年,卷(期)：2022.37(7)
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