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大麻PEBP基因家族鉴定及生物信息学分析

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[目的]对大麻中磷脂酰乙醇胺结合蛋白(phosphatidyl ethanolamine binding protein,PEBP)进行鉴定和生物信息学分析,为PEBP基因家族调控大麻的生长发育及开花奠定基础.[方法]以拟南芥PEBP家族基因作为参考序列,利用NCBI、MEME、TBtools等生物信息学工具对已有的大麻基因组数据进行筛选并鉴定大麻PEBP基因.[结果]从大麻基因组中共筛选出12个PEBP基因,分为FT-LIKE、TFL-LIKE、MET-LIKE三个亚家族,均为亲水性蛋白,分布于细胞质与细胞核中;motif1-motif5为大麻PEBP基因的特征基序,定位在7条染色体上.大麻PEBP基因含有2个外显子及2个以上内含子,其启动子主要含有光反应顺式调节元件、各类激素顺式调控元件,编码蛋白主要由无规则卷曲构成.[结论]共鉴定出12个CsPEBP基因家族成员,通过motif分析、多物种构建进化树,确定大麻PEBP基因具有高度保守性,并预测和分析其潜在的分子功能.
Identification and Bioinformatics of PEBP Family in Hemp

陈晗、徐洪国、王志刚、徐伟慧、葛宵启、祁宏英

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齐齐哈尔大学生命科学与农林学院,黑龙江 齐齐哈尔 161006

寒区麻及制品教育部工程研究中心,黑龙江 齐齐哈尔 161006

工业大麻 PEBP基因 功能鉴定 生物信息学分析

135409704

2022

10.19303/j.issn.1008-0384.2022.008.007

福建农业学报
福建省农业科学院

福建农业学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：0.656
ISSN：1008-0384
年,卷(期)：2022.37(8)
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