[目的]明确冬小包脚菇菌基土壤真菌和可培养内生真菌组成情况,为冬小包脚菇子实体分离及栽培奠定基础.[方法]以野生冬小包脚菇子实体及其菌基土壤为研究对象,采用传统组织分离法对子实体进行分离、纯化及ITS测序鉴定,并结合高通量测序法对菌基土壤真菌进行测序.[结果]分离得到的冬小包脚菇纯菌株属于Volvopluteus类群,也可属于传统定义的Volvariella类群.共得到冬小包脚菇内生真菌菌株50个,分属为3门13科16属20种,另有未定义科2个菌株,分别属于2个属,其中镰刀菌属(Fusarium)和毛霉属(Mucor)为优势属,且冬小包脚菇子实体内生真菌Shannon-Wiener多样性指数(H)为2.45,Simpson指数(D)为0.88,均匀度指数Pielou(J)为0.88,Margalef丰富度指数(R)为3.83.而冬小包脚菇菌基土壤中共检测到平均样品序列数67919个,鉴定出276种土壤真菌,归属于10门131科213属,优势属为被孢霉属(Mortierella)、瓶毛壳属(Lophotrichus)、假散囊菌属(Pseudeurotium)、Pseudaleuria和两个未定义属unclassified_o_Sordariales、unclassified_c_Sordariomycetes.3个土样平均Ace指数达298.7,Shannon指数达3.53,Simpson指数为0.08,Chao指数为304.23.[结论]冬小包脚菇可培养内生真菌和菌基土壤真菌都具有较为丰富的物种组成,该结论对冬小包脚菇菌种分离、培养、病虫害防治等栽培要点提供一定理论指导.