[目的]基于SSR分子标记鉴别福建百香果品种的遗传多样性,构建福建百香果品种的分子指纹图谱.[方法]基于转录组测序,开发西番莲SSR分析标记,并筛选出15个重复性好、多态性高的分子标记用于17个福建百香果品种(系)鉴定及遗传多态性分析,构建百香果品种(系)的SSR分子指纹图谱.[结果]利用MISA软件对1 kb以上的24319条西番莲(Passiflora caerulea L.)Unigene进行搜索,于8742条Unigene上检测出11385个SSR位点,出现频率为46.82％,平均分布距离为7.15 kb.单核苷酸、二核苷酸和三核苷酸分别占总SSR的63.72％、20.40％和14.28％,为数量较大的优势重复基序,其优势重复基元分别为A/T、AG/CT和AAG/CTT.通过Primer 3.0共获得出28257对SSR引物.从26对有效扩增引物中选择重复性好的15对引物,对17份百香果品种(系)进行多态性验证分析.15对SSR引物共产生235条多态性条带,PIC平均值为0.95.利用UPGMA进行聚类分析并作图,在遗传距离0.765处,可将17个品种(系)分为7个类群.根据15对多态性引物扩增电泳图,选出PFSSR20和PFSSR29引物组合用于构建DNA指纹图谱,可鉴别出17个百香果品种(系).[结论]利用西番莲转录组数据构建的SSR分子标记具有较高的多态性潜能,类型丰富,本研究基于此构建的DNA指纹图谱可分辨出17个百香果品种(系).
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