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濒危植物峨眉凤仙花叶绿体基因组分析

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[目的]对峨眉凤仙花(Impatiens omeiana Hook.f.)叶绿体基因组的结构特征及系统发育进行研究,为其资源保护及开发利用提供理论依据.[方法]基于峨眉凤仙花叶绿体基因组序列,利用生物信息学软件,对叶绿体基因组进行组装、注释、基因特征、序列重复和系统发育分析.[结果]峨眉凤仙花完整的叶绿体基因组长度为152527 bp,共有 130个基因,包括 86个蛋白质编码基因、8个rRNA基因和 36个tRNA基因,GC含量为 37％,且具有保守的四分体结构,包括大单拷贝区、小单拷贝区各 1个和 2个相同的反向重复区域,其长度分别为 83150、17903、25737 bp,其中 13个基因有 1个内含子,2个基因有 2个内含子.特征分析表明:峨眉凤仙花叶绿体全基因组中共检测到 76个SSR序列,且多以A/T单核苷酸序列为主,其长度为 10～91 bp;检测到 50842个密码子,其中以亮氨酸(Leu)最多,色氨酸(Tyr)最少;密码子偏好性分析显示 33个RSCU≥1的密码子多数以A/U结尾.通过邻接法(NJ)构建系统发育树发现,峨眉凤仙花与贵州凤仙花亲缘关系最近,均属于棒凤仙花亚属植物.[结论]峨眉凤仙花叶绿体基因组呈典型的四分体结构,SSR序列以A/T单碱基为主;系统发育分析结果将其归为棒凤仙花亚属,上述结果为峨眉凤仙花系统发育学地位及物种鉴定工作提供了重要的分子信息.
Complete Chloroplast Genome of Endangered Impatiens omeiana

赵秋燕、曹孟会、李新艺、周敏、魏春梅、张茜、瞿素萍、黄海泉、黄美娟

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西南林业大学园林园艺学院/西南林业大学园林园艺花卉研发中心,云南 昆明 650224

云南省农业科学院花卉研究所,云南 昆明 650205

峨眉凤仙花 叶绿体基因组 序列结构与特征分析 系统发育

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2023

10.19303/j.issn.1008-0384.2023.02.007

福建农业学报
福建省农业科学院

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CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：0.656
ISSN：1008-0384
年,卷(期)：2023.38(2)
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