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斑点叉尾鮰EGFL9基因变异位点与生长性状的关联分析

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[目的]研究斑点叉尾鮰表皮生长因子样结构域蛋白EGFL9(Multiple epidermal growth factor-like domains protein 9)基因与其生长性状的相关性,为斑点叉尾鮰的分子标记辅助育种奠定基础.[方法]采用靶向基因测序技术对EGFL9基因进行测序,与参考基因组比对后筛选变异位点,并将获得的变异位点与生长性状进行关联分析.[结果]在EGFL9上共发现27个多态位点,经过滤,获得22个有效突变位点,其中4个变异位点(g.142、g.573、g.3079、g.7409)对斑点叉尾鮰的生长性状具有显著影响,位点g.142、g.3079、g.7409位于内含子中,位点g.573位于第2外显子上;g.142位点的A/A型个体的平均体长显著高于A/G型个体(P<0.05);g.7409位点A/G型个体的平均体长显著高于G/G型、A/A型个体(P<0.05);g.3079位点C/C型个体的平均体质量和体长均显著高于A/A型个体(P<0.05);位于外显子上的InDel位点g.573使EGFL9基因编码蛋白减少了一个苏氨酸残基,对蛋白质三级结构产生较为明显的影响,该位点TACC/T型个体的平均体质量显著高于TACC/TACC型个体(P<0.05),平均体长显著高于TACC/TACC型与T/T型个体(P<0.05).[结论]获得的4个斑点叉尾鮰生长相关标记(g.142、g.573、g.3079、g.7409)与其生长性状显著关联,可以应用于后续斑点叉尾鮰育种芯片开发和分子标记辅助育种.
Variation Sites on EGFL9 Associated with Growth of Channel Catfish

张文平、张世勇、刘洪岩、徐思琪、王明华、钟立强、边文冀、朱明、陈校辉

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江苏海洋大学海洋科学与水产学院,江苏 连云港 222005

江苏省淡水水产研究所,江苏 南京 210017

江苏省农业种质资源保护与利用平台,江苏 南京 210014

斑点叉尾鮰 EGFL9 SNP 生长性状 关联分析

江苏省农业重大新品种创制项目国家现代农业产业技术体系建设专项江苏省现代农业产业技术体系建设项目

PZCZ201741CARS-46JATS2022413

2023

10.19303/j.issn.1008-0384.2023.03.001

福建农业学报
福建省农业科学院

福建农业学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：0.656
ISSN：1008-0384
年,卷(期)：2023.38(3)
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