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番茄WRKY转录因子比较鉴定及细菌胁迫响应

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[目的]深入了解番茄WRKY转录因子的组学特征及其生物胁迫响应.[方法]基于最新公共数据,利用生物信息学和比较基因组学方法对番茄WRKY进行系统鉴定,结合抗、感2个番茄自交系在青枯菌侵染前后的RNA-seq数据,挖掘青枯病抗性相关WRKY.[结果]85个番茄WRKY转录因子被鉴定,可分为I、IIa+b、IIc、IId+e和III等类别,Ⅱe基因最多.其中,9个基因七肽基序发生了单一氨基酸变异,WRKYGKK为优势突变型.这些WRKY主要分布在5号染色体,且具有端部和成簇分布现象,尤其是IIe亚类.45.88％的番茄WRKY具有共线性.58.82％的番茄WRKY(主要是I和Ⅱc类)与拟南芥和辣椒WRKY形成73对直系同源基因,其选择压力(Ka/Ks)均小于1.16个番茄WRKY(主要是IIa+b和IIc类)对几种生物胁迫反应强烈,且主要在根中表达.12个差异表达WRKY(主要是III和IIb类)被鉴定,其中Solyc03g095770.3(III)与Solyc09g014990.4(I)互作在番茄青枯病响应中发挥重要作用.[结论]综合鉴定了番茄WRKY转录因子,筛选到12个青枯病响应基因.
Identification and Pathogenic Response of Tomato WRKY Transcription Factors

水德聚、孙继、熊自立、徐焕文、张圣美、史建磊

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温州科技职业学院/浙南作物育种重点实验室,浙江 温州 325006

番茄 WRKY转录因子 基因特征 生物胁迫 转录表达

浙江省农业新品种选育重大科技专项子课题浙江省农业高质量发展专项温州市农业新品种选育协作组项目

2021C02065浙种202158号2019ZX007

2023

10.19303/j.issn.1008-0384.2023.03.004

福建农业学报
福建省农业科学院

福建农业学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：0.656
ISSN：1008-0384
年,卷(期)：2023.38(3)
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