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大白菜F-BOX基因家族的鉴定与核盘菌诱导应答分析

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[目的]筛选参与菌核病应答反应的F-BOX基因,为大白菜抗菌核病基因的功能研究及抗病品种的选育提供基础.[方法]基于核盘菌侵染大白菜转录组测序数据,对大白菜F-BOX基因家族进行鉴定,进行亚细胞定位、染色体定位、保守结构域等生物信息学分析.分析F-BOX基因在核盘菌侵染下的差异表达,并采用q-PCR技术检测F-BOX基因在0 h和36 h的表达情况.[结果]共鉴定32个BraF-BOX基因,分子量介于34751.13～105942.22 Da;亚细胞定位表明,26个F-BOX基因定位在细胞核和细胞质中,6个定位在叶绿体中;系统进化树分析将BraF-BOX分为4个亚族;基因结构分析结果表明,每个BraF-BOX家族成员均含有Motif 1,序列中均含有外显子;组织特异性表达分析结果表明在不同大白菜部位,表达量有差异;在核盘菌处理36 h时,q-PCR检测6个基因的相对表达量趋势与转录组数据一致,其中Bra037120、Bra011427、Bra009835等3个基因表达上调,核盘菌侵染时间越长,表达量越大.[结论]综合BraF-BOX基因生物信息学及转录组数据分析,Bra037120、Bra011427、Bra009835基因可能参与大白菜菌核病抗性功能,为后续基因功能研究提供研究基础.
Genome-wide Identification and Transcript Response to Sclerotinia of F-BOX Genes in Chinese Cabbage

冯冬林、钟开勤、丁玲、刘美琴

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福建农业职业技术学院,福建 福州 350001

福州市蔬菜科学研究所,福建 福州 350111

大白菜 F-BOX基因家族 菌核病 基因表达

福建省科技计划引导性项目福建省现代农业蔬菜产业技术体系项目福建农业职业技术学院科技项目

2020N0022闽财教指202161号2019JS008

2023

10.19303/j.issn.1008-0384.2023.03.005

福建农业学报
福建省农业科学院

福建农业学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：0.656
ISSN：1008-0384
年,卷(期)：2023.38(3)
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