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锦葵科作物SSR标记在玫瑰茄中的通用性分析

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[目的]丰富玫瑰茄(Hibiscus sabdariffa L.)SSR分子标记的种类和数量,验证锦葵科作物SSR标记在玫瑰茄中的通用性,进而分析玫瑰茄的遗传多样性.[方法]选取锦葵科红麻、棉花、黄秋葵和木槿等4种作物共62对SSR引物(木槿17对,其他各15对),对8份不同来源的玫瑰茄种质进行多态性分析.[结果]62对SSR引物中有58对具有通用性,占比为93.5%;通用性引物中有48对具有多态性,占比为82.8%;这些引物共扩增出246条条带,其中多态性条带239条,占比97.2%.同时,棉花有14对SSR引物具有多态性,多态性引物比率最高,达86.7%;其次是木槿,有82.4%的引物具有多态性,且其引物多态信息含量值(PIC)最高,为0.685;而黄秋葵和红麻多态性引物比率较低,分别为73.3%和66.7%.另外,聚类分析结果表明,在相似系数0.49处可将8份玫瑰茄种质分为3个各具特点的亚类,其中19FZ-76被单独聚为一类,表明这一种质与其他7份种质亲缘关系最远,遗传差异最大,聚类结果与其表型性状表现一致;而来自缅甸的19FZ-74和漳州本地种遗传相似系数最高,说明这两份种质的亲缘关系较近,遗传差异较小,表明我国福建种植的玫瑰茄品种与东南亚的品种有较近的血缘关系,有可能从东南亚引种而来.[结论]锦葵科作物的SSR引物在玫瑰茄中具有较好的通用性,筛选出的SSR标记可为玫瑰茄品种鉴定、亲缘关系分析、遗传图谱构建等遗传学研究提供可靠方法.
Universality of Simple Sequence Repeat (SSR) Markers from Malvaceae plants to Roselle (Hibiscus sabdariffa L.)

李云清、谢瑞真、李静、林荔辉、陈冀涵、方平平、陶爱芬

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福建农林大学作物遗传育种与综合利用教育部重点实验室,福建 福州 350002

福建省作物设计育种重点实验室,福建 福州 350002

福建农林大学金山学院,福建 福州 350002

玫瑰茄 SSR标记 通用性 遗传多样性

国家现代农业产业技术体系建设专项福建省南方麻类种质资源共享平台项目福建农林大学校内创新基金福建农林大学校内创新基金

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2023

福建农业学报
福建省农业科学院

福建农业学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子:0.656
ISSN:1008-0384
年,卷(期):2023.38(3)
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