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辣椒海藻糖-6-磷酸合酶基因CaTPS9的克隆及表达分析

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[目的]明确辣椒中海藻糖-6-磷酸合酶(TPS)基因CaTPS9的表达特性和生物学功能,进一步了解TPS对辣椒生长中调控非生物胁迫的作用.[方法]以辣椒品种强丰 101为试验材料,克隆CaTPS9基因,并对辣椒CaTPS9的理化性质、蛋白结构、顺式作用元件、系统进化树等进行分析;通过qRT-PCR分析CaTPS9基因在不同组织(商品果果肉、幼果果肉、成熟果果肉、商品果胎座、幼果胎座、成熟果胎座、叶、根、茎、花)和胁迫处理(低温和植物生长调节剂处理)中的表达模式.[结果]CaTPS9基因CDS序列全长 2604 bp,编码 867个氨基酸.CaTPS9蛋白包含Glyco_transf_20和Trehalose_PPase两个保守结构域,分子质量为 97.60 kDa,不稳定指数为 44.27,理论等电点为 5.63,亚细胞定位预测CaTPS9蛋白位于细胞质中.生物信息学分析表明,CaTPS9蛋白属于亲水性蛋白,且不存在跨膜结构和信号肽序列,蛋白结构主要由α-螺旋和无规则卷曲组成.系统进化关系分析表明,CaTPS9与烟草(Nicotiana tabacum L.)、番茄(Solanum lycopersicum L.)和马铃薯(Solanum tuberosum L.)中的同源基因亲缘关系较近.启动子顺式作用元件分析表明,CaTPS9启动子区域含有与激素、胁迫及植物生长发育相关的顺式作用元件.此外,CaTPS9在叶片中表达量最高,在商品果胎座中表达量最低.在水杨酸(Salicylic acid,SA)处理 12h后CaTPS9基因的表达量被显著提升,而低温、吲哚乙酸(3-indoleacetic acid,IAA)、脱落酸(Abscisic acid,ABA)、赤霉素(Gibberellin acid,GA3)和茉莉酸甲酯(Methyl jasmonate,MeJA)处理能够显著抑制CaTPS9基因表达量.[结论]CaTPS9基因可能通过海藻糖生物合成途径响应逆境胁迫.
Bioinformatics and Expression of CaTPS9 in Chili Peppers

Chili pepperTPSbioinformaticsabiotic stressexpression analysis

黄立娟、魏敏、苟秉调、段盼盼、郭娜纳、魏兵强

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甘肃农业大学园艺学院,甘肃 兰州 730070

辣椒 海藻糖-6-磷酸合酶 生物信息学 非生物胁迫 表达分析

国家自然科学基金甘肃省重点研发计划兰州市人才创新创业项目甘肃农业大学青年导师扶持基金

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2023

福建农业学报
福建省农业科学院

福建农业学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子:0.656
ISSN:1008-0384
年,卷(期):2023.38(7)
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