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基于转录组测序的金钱蒲类黄酮生物合成基因的表达分析

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[目的]高通量测序获取金钱蒲(Acorus gramineus)7个不同组织转录组信息,为不同组织中类黄酮化学成分合成差异提供分子信息,进而在分子水平上研究金钱蒲不同组织内类黄酮化学成分合成差异.[方法]利用高通量测序技术平台完成金钱蒲 7个不同部位的转录组测序,对unigenes进行功能注释,借助注释结果挖掘类黄酮生物合成通路,筛选通路中的差异表达基因(Differentially expressed genes,DEGs)并进行表达量分析.[结果]共获得高质量数据39.91~42.97 M,总碱基量为5.98~6.45 Gb,Q30碱基百分比大于94.05%,GC含量为47.81%~50.32%.18616条unigenes在GO数据库中获得 62506个注释,根据功能划分为细胞组分、分子功能及生物过程三大类,分别对应 6、14、21个亚类,大量基因分布在细胞解剖实体、连接、催化活性和细胞过程等亚类中.10124条unigenes富集在KEGG数据库的5大类19个亚类中,从其中筛选出4条类黄酮生物合成途径,14个关键酶,63个差异表达酶基因.这些基因在金钱蒲 7个组织中具有表达差异性,表明这些结构基因在类黄酮生物合成过程中于不同部位发挥作用.[结论]研究结果丰富了金钱蒲的遗传信息,也为进一步解析金钱蒲类黄酮生物合成基因功能提供参考依据.
Expressions of Flavonoid Biosynthesis Genes in Acorus gramineus Determined by Transcriptome Sequencing

Acorus gramineustranscriptomeflavonoidsexpression analysis

陈钰、马良、饶雪娥、何舒澜

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福建卫生职业技术学院药学院,福建 福州 350101

金钱蒲 转录组 类黄酮 基因表达量

福建省教育厅中青年教师教育科研项目福建省科技特派员专项(2022)

JAT191292

2023

福建农业学报
福建省农业科学院

福建农业学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子:0.656
ISSN:1008-0384
年,卷(期):2023.38(8)
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