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茶树炭疽菌N425全基因组测序与基因功能注释

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[目的]对茶树炭疽菌N425进行全基因组测序和基因功能注释并从中初筛出致病相关基因.[方法]通过Illumina HiSeq2500 PE150平台对N425菌株进行全基因组测序和组装,并利用NR、KEGG、KOG等功能基因数据库进行基因预测和功能注释.[结果]茶树炭疽菌N425基因组全长约56.3 Mbp,G+C含量为53.2％,共预测出10157个蛋白编码基因和若干各类非蛋白编码序列.其中,1356个基因在病原与宿主互作数据库(PHI)中得到注释,包括140个注释为致病力丧失的基因;720个基因在碳水化合物酶数据库(CAZy)中得到注释;302个基因被预测为次生代谢物相关基因.这些基因中有涉及cAMP-PKA、MAPK等信号通路以及降解宿主细胞壁等致病相关过程,是潜在的致病相关基因.[结论]本研究成功获得茶树炭疽菌N425全基因组序列和基因功能注释,并从中挖掘出潜在致病相关基因,为后续展开对茶树炭疽菌侵染茶树的致病分子机制研究奠定基础.
Sequence and Annotation of Colletotrichum fructicola N425 Genome on Tea Plant

Tea plant anthracnosewhole-genome sequencegene annotationvirulence-related genes

张承康、周子文、郭田龙、彭成彬、陈美霞、刘伟

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宁德师范学院生命科学学院省级产学研合作示范基地,福建 宁德 352100

福建农林大学生物农药与化学生物学教育部重点实验室,福建 福州 350002

茶树炭疽病 基因组测序 基因注释 致病相关基因

国家自然科学基金项目生物农药与化学生物学教育部重点实验室开放课题宁德师范学院科研项目宁德师范学院科研项目

32001853Keylab2020-052020Y022022T01

2023

10.19303/j.issn.1008-0384.2023.12.007

福建农业学报
福建省农业科学院

福建农业学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：0.656
ISSN：1008-0384
年,卷(期)：2023.38(12)
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