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基于高通量测序对南极菲尔德斯半岛土壤微生物多样性的初步研究

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南极地区环境恶劣、人迹罕至但微生物较为丰富，土壤中存在着极为丰富的微生物群落，这些土壤微生物为适应南极极端环境形成了独特的生物多样性、遗传机制和代谢途径。本文为了探究南极地区土壤微生物的生物多样性和群落结构，以中国第31次南极科学考察采自菲尔德斯半岛3 个站点的土壤样本作为研究对象，提取土壤微生物的宏基因组DNA，基于Illumina NovaSeq 6000测序平台和Paired-end 150测序策略进行高通量测序，通过生物信息学分析对南极土壤微生物的多样性进行了初步研究。使用MetaPhlAn2进行数据分析并用GraPhlAn对结果进行可视化，结果显示3例土壤样本中的微生物来自于8门14纲21目32科48属62种，其中假单胞杆菌属(Pseudomonas) 是优势细菌菌群，白色念珠菌(Can-dida albicans) 是优势真菌菌群。通过分析菲尔德斯半岛采集的样本，表明南极地区具有丰富的微生物种群多样性。本研究不仅有助于探究南极等极端环境中微生物的物种多样性，还为后期新菌的分离培养、活性物质的提取、功能基因的筛选、群落结构的研究等提供了实验依据和信息资源。
High-throughput sequencing analysis of soil microbial diversity from Antarctic Fildes Peninsula

李桂秀、宋易洋、赵芯、王国良

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烟台大学生命科学学院,山东 烟台264005

北京市农林科学院北京农业生物技术研究中心,北京100097

南极 土壤微生物 宏基因组 生物多样性 高通量测序

国家自然科学基金面上项目

41476166

2020

渔业研究
福建省水产学会　福建省水产研究所

渔业研究

影响因子：0.46
ISSN：1006-5601
年,卷(期)：2020.42(3)
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