基于GEO和TCGA数据库探讨奥希替尼治疗非小细胞肺癌耐药的潜在机制

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万方数据
维普

中文摘要：目的本研究旨在通过基因表达综合数据库(gene expression omnibus，GEO)和癌症基因组图谱(the cancer genome atlas，TCGA)数据库分析非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer，NSCLC)与奥希替尼耐药的相关基因表达数据，以揭示奥希替尼耐药的潜在机制，并寻找新的治疗靶点或组合疗法策略。方法筛选GEO数据库中的NSCLC和奥希替尼耐药数据集，分别为GSE1987和GSE165029;通过R软件包对基因表达数据进行差异分析、功能富集分析和蛋白质-蛋白质相互作用网络构建;进一步分析关键基因在TCGA数据集中的表达情况及其与生存率的相关性。结果从GSE1987数据集中筛选出840个差异表达基因，其中403个显著上调，437个显著下调;GSE165029数据集筛选出468个差异表达基因，267个显著上调，201个显著下调。交集分析得到18个重叠的关键基因。GO和KEGG分析显示，这些基因主要涉及平滑肌收缩的调节、泛素蛋白连接酶活性的正调控等功能。PPI网络分析揭示，PLK1和CDC20的相互作用最为显著。PLK1和CDC20在NSCLC组织中的高表达与较差的生存预后相关。结论本研究鉴定了多个与奥希替尼耐药性相关的关键基因，并揭示了其可能的生物学功能。这些发现为进一步理解奥希替尼耐药机制提供了新的见解，并为未来的NSCLC治疗提供了潜在的靶点和策略。

作者：

魏丽春

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作者单位：

福建省平潭综合实验区医院药剂科,平潭 350400

关键词：

奥希替尼非小细胞肺癌 GEO数据库 TCGA数据库

出版年：

2024

DOI：

10.20148/j.fmj.2024.08.010

福建医药杂志

中华医学会福建分会

福建医药杂志

影响因子：0.525

ISSN：1002-2600

年,卷(期)：2024.46(8)