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基于拉伸分子动力学模拟的黄嘌呤氧化酶抑制剂解离途径的理论研究

Theoretical Study on the Unbinding Pathway of Xanthine Oxidase Inhibitors Based on Steered Molecular Dynamics Simulation

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采用拉伸分子动力学模拟的方法研究了黄嘌呤氧化酶(Xanthine oxidase,XO)抑制剂别嘌呤醇(Allopuri-nol)和葛根素(Puerarin)从XO离去通道解离的动态过程.分子对接结果表明,别嘌呤醇和葛根素均结合在XO的钼蝶呤中心(Molybdopterin,Mo-pt);丙氨酸扫描的结果显示,Val789,Arg880,Phe911,Phe914和Val1081在XO与抑制剂的结合中起到非常重要的作用.拉伸分子动力学模拟结果显示,相比于葛根素,别嘌呤醇需要更大的外力和更长的时间才能从XO中解离,拉伸过程中Arg880,Phe1009,Thr1010,Val1011和Ala1079均对维持2种复合物的结构稳定起到重要作用,Phe649和Phe1013在抑制剂解离过程中起到门控的作用,His875起到阻碍抑制剂解离的作用.

齐人睿、李明昊、常浩、付学奇、高波、韩葳葳、韩璐、李婉南

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吉林大学分子酶学工程教育部重点实验室,生命科学学院,长春130012

吉林省特医食品生物科技有限公司,长春130052

黄嘌呤氧化酶 别嘌呤醇 葛根素 痛风 拉伸分子动力学模拟

吉林省科技发展计划项目

20200801069GH

2021

10.7503/cjcu20200752

高等学校化学学报
中华人民共和国教育部委托 吉林大学和南开大学

高等学校化学学报

CSTPCDCSCD北大核心SCI
影响因子：1.067
ISSN：0251-0790
年,卷(期)：2021.42(3)
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