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北红葡萄组织培养生根期愈伤组织的转录组分析

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[目的]探究北红葡萄生根的分子机理,为北红葡萄繁育中生根提供理论和实践指导.[方法]将北红葡萄组织培养至生根期,筛选出较为适合生根的培养基类型后,正交试验设计以不同质量浓度IBA(0.1、0.3和0.5 mg/L)、NAA(0.1、0.3和0.5 mg/L)和蔗糖(15、25和35 g/L)进行处理,统计处理20 d后各处理的生根情况,并对基部生根愈伤组织进行转录组测序分析.[结果]1/2B5培养基较为适合北红葡萄生根.转录组测序的6个样本共获得的高质量序列共254.80 Gb,样品有88.13%～89.94%的序列可以比对到参考基因组上,DEGs以上调表达为主.对植物激素信号转导通路进行分析,有7个DEGs可能对其生根有重要作用,生长素途径中的14个DEGs上调表达.进行qRT-PCR验证,转录组数据可信,相关系数为0.89.[结论]转录组分析得到了在北红葡萄生根期中重要的通路和关键基因,为北红葡萄生根提供理论和实践指导.
Transcriptome analysis of callus at rooting stage in Beihong grape tissue culture

Bbeihong grapecallusrootingtranscriptome sequencing

韦伟、单守明、李光宗、许文娣

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宁夏大学农学院,宁夏 银川 750021

商洛学院生物医药与食品工程学院,陕西 商洛 726000

北红葡萄 愈伤组织 生根 转录组测序

宁夏自然科学基金

2020AAC03093

2023

10.13432/j.cnki.jgsau.2023.04.014

甘肃农业大学学报
甘肃农业大学

甘肃农业大学学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：0.612
ISSN：1003-4315
年,卷(期)：2023.58(4)
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