球茎甘蓝qRT-PCR内参基因的筛选及稳定性验证
Screening and stability verification of kohlrabi reference genes
郭怡婷 1孙世英 1赵文菊 1王鑫淼 1李晓娟 1马一栋 1任延靖2
作者信息
- 1. 青海大学,青海 西宁 810016;青海大学农林科学院,青藏高原种质资源研究与利用实验室,青海 西宁 810016
- 2. 青海大学,青海 西宁 810016;青海大学农林科学院,青藏高原种质资源研究与利用实验室,青海 西宁 810016;青海大学,三江源生态和高原农牧业国家重点实验室,青海 西宁 810016
- 折叠
摘要
[目的]通过对已知内参基因进行筛选,确定球茎甘蓝最合适的内参基因,确保实时荧光定量PCR(qRT-PCR)的准确表达.[方法]本试验选择了11种参考基因,利用GeNorm、Normalfinder和Bestkeep软件对紫色球茎甘蓝和绿色球茎甘蓝不同部位的内部参考基因进行了分析.[结果]3个分析结果显示,内参基因Tip41在球茎甘蓝不同组织部位表达最稳定.[结论]Tip41是作为内参基因的最佳选择,为球茎甘蓝后续的分子生物学相关研究提供基础.
Abstract
[Objective]By screening known reference genes,the most appropriate reference genes in cab-bage were identified to ensure the accurate expression of quantitative real-time PCR(QRT-PCR).[Method]Eleven reference genes were selected in this experiment,and the internal reference genes of dif-ferent parts of purple and green cabbage were analyzed by GeNorm,Normalfinder and Bestkeep software.[Result]Three analysis results showed that the internal reference gene Tip41 was expressed most stably in different tissue parts of kohlrabi.[Conclusion]Tip41 was the best choice as an internal reference gene,pro-vide a basis for the subsequent molecular biology related studies of kohlrabi.
关键词
球茎甘蓝/内参基因/荧光定量Key words
kohlrabi/reference gene/quantitative real-time PCR引用本文复制引用
基金项目
国家大宗蔬菜产业技术体系-西宁综合试验站项目(CARS-23-G26)
青藏高原种质资源研究与利用实验室(2022-ZJ-Y01)
青海省重点研发与转化项目(2021-NK-124)
西宁市重大科技专项项目(2021-Z-03)
出版年
2024
NETL
NSTL
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