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基于生物信息学探讨中药调节铁死亡干预肝癌的用药规律

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为了探讨中药调节铁死亡干预肝癌的化合物及用药规律,通过FerrDb、TCGA数据库及R软件,获取肝癌中铁死亡差异靶点并进行富集分析.以ADME参数和Lipinski规则为过滤条件,利用TCMSP平台筛选可作用于差异靶点的化合物及中药,并构建靶点-化合物、靶点-化合物-中药网络.运用中医传承计算平台对用药规律进行分析.借助AutoDock Vina软件将网络中核心化合物与作用靶点进行分子对接,以评估其结合强度.结果表明:共获得84个差异靶点,其中13个靶点可匹配到化合物,共收集到103个候选化合物及277味中药.富集分析得出铁死亡、花生四烯酸代谢、血管内皮生长因子(VEGF)、哺乳动物雷帕霉素靶点蛋白(mTOR)等信号通路.用药规律分析显示,药性以寒、温、平为主,药味以苦、辛、甘味最多,归经则以肝经、肺经、脾胃经、肾经常见,中药功效以清热解毒类、补虚类、活血化瘀类为主.48组分子对接得分均小于-4.25 kcal/m11ol,平均得分为-8.38 kcal/mol.本次研究系统分析了中药调节铁死亡治疗肝癌的用药规律,并初步分析了铁死亡干预肝癌的作用机制,可为后续中药调节铁死亡的基础研究提供思路.
Regularity of traditional Chinese medicine regulating ferroptosis in intervention liver cancer based on bioinformatics

姚元谦、刘英、杨玉雯、吕建林、黄晶晶

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广西中医药大学,广西南宁530001

广西中医药大学第一附属医院,广西南宁530023

铁死亡 肝癌 生物信息学 用药规律

国家自然科学基金广西自然科学基金广西研究生教育创新计划广西壮族自治区高等学校中青年教师(科研)基础能力提升项目广西中医基础研究重点实验室开放基金

818608392020GXNSFAA238020JGY20211102021KY0300K201137910

2022

10.13624/j.cnki.issn.1001-7445.2022.0235

广西大学学报(自然科学版)
广西大学

广西大学学报(自然科学版)

CSTPCD北大核心
影响因子：0.767
ISSN：1001-7445
年,卷(期)：2022.47(1)
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