工业微生物2024,Vol.54Issue(6) :131-134.DOI:10.3969/j.issn.1001-6678.2024.06.036

印度梨形孢效应蛋白CSN5的生物信息学分析

Bioinformatic Analysis of the CSN5 Effector Protein of Piriformospora Indica

刘凌云 吕玉茹 周子晨 王汶淏 岳静
工业微生物2024,Vol.54Issue(6) :131-134.DOI:10.3969/j.issn.1001-6678.2024.06.036

印度梨形孢效应蛋白CSN5的生物信息学分析

Bioinformatic Analysis of the CSN5 Effector Protein of Piriformospora Indica

刘凌云 1吕玉茹 1周子晨 1王汶淏 1岳静1
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作者信息

  • 1. 沈阳化工大学,辽宁沈阳 110142
  • 折叠

摘要

文章通过分析CSN5效应蛋白,为印度梨形孢与植物互作研究提供了新的思路和方向,有助于深入探究相关问题.同时,采用生物信息学软件Protpapram、ProtScale、NCBI-CD-search等预测了 CSN5的主要特性.CSN5蛋白由369个氨基酸组成,为稳定亲水性蛋白,且其特异性保守结构域属于Mov34/MPN/PAD-1家族.生物信息学分析表明,CSN5蛋白保守性较强,能够与多种蛋白相互作用去泛素化,为效应蛋白提高植物抗逆性奠定了基础.

Abstract

In this study,the analysis of CSN5 effector protein provides a new idea and direction for the research of the interaction between Piriformospora indica and plants,and is helpful to further explore related problems.Bioinformatics software,such as Protpapram,ProtScale and NCBI-CD-search are used to predict the main characteristics of CSN5.CSN5 protein is composed of 369 amino acids and is a stable hydrophilic protein with a specific conserved domain belonging to the Mov34/MPN/PAD-1 family.The bioinformatic analysis shows that the CSN5 protein has strong conservation and can interact with many proteins to achieve the deubiquitination,which lays a foundation for effector proteins to improve plant stress resistance.

关键词

印度梨形孢/效应蛋白/生物信息学

Key words

Piriformospora indica/effector protein/bioinformatics

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出版年

2024
工业微生物
全国工业微生物信息中心 上海市工业微生物研究所

工业微生物

影响因子:0.293
ISSN:1001-6678
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