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印度梨形孢效应蛋白CSN5的生物信息学分析

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文章通过分析CSN5效应蛋白,为印度梨形孢与植物互作研究提供了新的思路和方向,有助于深入探究相关问题。同时,采用生物信息学软件Protpapram、ProtScale、NCBI-CD-search等预测了 CSN5的主要特性。CSN5蛋白由369个氨基酸组成,为稳定亲水性蛋白,且其特异性保守结构域属于Mov34/MPN/PAD-1家族。生物信息学分析表明,CSN5蛋白保守性较强,能够与多种蛋白相互作用去泛素化,为效应蛋白提高植物抗逆性奠定了基础。
Bioinformatic Analysis of the CSN5 Effector Protein of Piriformospora Indica
In this study,the analysis of CSN5 effector protein provides a new idea and direction for the research of the interaction between Piriformospora indica and plants,and is helpful to further explore related problems.Bioinformatics software,such as Protpapram,ProtScale and NCBI-CD-search are used to predict the main characteristics of CSN5.CSN5 protein is composed of 369 amino acids and is a stable hydrophilic protein with a specific conserved domain belonging to the Mov34/MPN/PAD-1 family.The bioinformatic analysis shows that the CSN5 protein has strong conservation and can interact with many proteins to achieve the deubiquitination,which lays a foundation for effector proteins to improve plant stress resistance.

Piriformospora indicaeffector proteinbioinformatics

刘凌云、吕玉茹、周子晨、王汶淏、岳静

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沈阳化工大学,辽宁沈阳 110142

印度梨形孢 效应蛋白 生物信息学

2024

工业微生物
全国工业微生物信息中心 上海市工业微生物研究所

工业微生物

影响因子:0.293
ISSN:1001-6678
年,卷(期):2024.54(6)