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PCR-DGGE法检测大鼠胃肠道菌群结构的电泳条件探讨

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目的:探讨PCR-DGGE技术检测大鼠肠道菌群结构的电泳条件,以获得更好的DGGE电泳图谱优化实验方法.方法:常规采集大鼠胃肠道各节段(胃、十二指肠、空肠、回肠、结肠)及内容物,提取细菌总DNA,采用细菌16srDNA V3区通用引物进行PCR扩增,扩增产物在6种不同电泳条件下(分别为:200v、60℃、4h;150v、60℃、4h;150v、60℃、4.5h;150v、60℃、6h;150v、60℃、8h;85v、60℃、16h)进行DGGE分析并比较不同方法的优缺点.结果:同一样本在不同电泳条件下的PCR-DGGE图谱多样性指数、清晰度、条带数、位置等有显著性差异,其中以(200v、60℃、4h)条件下的分析效率最佳.结论:电压、温度和时间等电泳条件可影响PCR-DGGE图谱多样性指数、清晰度、条带数、位置,在本实验条件下以(200v、60℃、4h)的电泳图谱效果最佳.
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吴云、段智璇、陈瑞、田维毅

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贵阳中医学院,贵州贵阳550002

16s rDNA PCR-DGGE 大鼠 肠道菌群 电泳条件

国家自然科学基金

8360589

2016

10.16588/j.cnki.issn.1002-1108.2016.03.005

贵阳中医学院学报
贵阳中医学院

贵阳中医学院学报

影响因子：1.18
ISSN：1002-1108
年,卷(期)：2016.38(3)
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