基于转录组鉴定吊石苣苔干旱响应基因

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中文摘要：目的:研究药用植物吊石苣苔在干旱胁迫下的基因表达变化和应答分子机制.方法:对吊石苣苔进行干旱处理,并利用转录组测序开展基因表达等内容的综合分析.结果:通过体外组装,共获得149 093个单基因(unigene),其中92 769个单基因在Nr、COG等4个数据库中获得注释.与对照相比,4 h干旱胁迫识别了上调表达基因7 108个,下调表达基因6 638个;15 h干旱胁迫识别了上调表达基因4 493个,下调表达基因5 387个.实验对这些差异表达基因进行了基因功能分类和调控通路注释.结论:吊石苣苔在干旱胁迫下可能与防御应答、光刺激应答、光合作用和干旱应答等多个过程有关.本实验为吊石苣苔干旱应答分子机制相关研究提供基础和参考.

作者：

刘琳烁、陈宏宇、王国宝、李杨梅、刘梦圆

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作者单位：

贵州中医药大学药学院,贵州贵阳 550025

关键词：

吊石苣苔干旱转录组基因

基金：

贵州中医药大学大学生创新创业训练项目

项目编号：

贵中医大创合字[2022]111号

出版年：

2024

DOI：

10.16588/j.cnki.issn2096-8426.2024.01.007

贵州中医药大学学报

ISSN：

年,卷(期)：2024.46(1)

参考文献量16