解放军医药杂志2022,Vol.34Issue(3) :101-107.DOI:10.3969/j.issn.2095-140X.2022.03.023

基于不同病理阶段生物信息学分析筛选强直性脊柱炎治疗中药有效成分

Screening of Effective Components of Traditional Chinese Medicine in Treatment of Ankylosing Spondylitis Based on Bioinformatics Analysis of Different Pathological Stages

王志强 宫彩霞 李振彬
解放军医药杂志2022,Vol.34Issue(3) :101-107.DOI:10.3969/j.issn.2095-140X.2022.03.023

基于不同病理阶段生物信息学分析筛选强直性脊柱炎治疗中药有效成分

Screening of Effective Components of Traditional Chinese Medicine in Treatment of Ankylosing Spondylitis Based on Bioinformatics Analysis of Different Pathological Stages

王志强 1宫彩霞 2李振彬1
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作者信息

  • 1. 050082 石家庄,解放军联勤保障部队第九八〇医院风湿免疫科
  • 2. 210023 南京,南京中医药大学第一临床医学院
  • 折叠

摘要

目的 通过对强直性脊柱炎(AS)不同病理阶段的生物信息学进行分析,筛选出有潜在治疗作用的中药有效成分.方法 从GeneCards数据库检索获得AS炎症损伤阶段和结构性损伤阶段靶点,STRING平台构建蛋白质相互作用网络,用Cytoscape软件对网络进行可视化处理并用cytoHubba插件进行拓扑分析,筛选出核心靶点.对MCODE插件分析获得的分值较高的靶点进行GO和KEGG通路富集分析,获得AS涉及的生物学功能和信号通路.根据核心靶点,在中药系统药理数据库与分析平台获取可作用于核心靶点的中药有效成分,并以口服生物利用度≥30%和类药性≥0.18为条件进行筛选.最后,用Discovery Studio软件对筛选得到的中药有效成分和目前指南推荐药物的作用靶点进行分子对接验证.结果 在GeneCards数据库检索获得AS炎症损伤阶段靶点103个、结构性损伤阶段靶点109个.网络分析筛选出炎症损伤阶段核心靶点为IL6、TNF、IL10、CSF2、IL17A、IL1B、CXCL8、IFNG、TLR4、IL18,结构性损伤阶段核心靶点为IL6、GAPDH、VEGFA、INS、CXCL8、CCL2、STAT3、TNF、IL1B、PTGS2,涉及细胞因子-细胞因子受体相互作用、类风湿关节炎、炎性肠病、疟疾、Chagas病、IL17、Th17细胞分化等信号通路.在中药系统药理数据库与分析平台筛选到的潜在中药有效成分包括槲皮素、表没食子儿茶素没食子酸酯、汉黄芩素、漆黄素和雷公藤甲素.分子对接结果显示这些中药有效成分均可与目前指南推荐药物的靶点稳定对接.结论 本研究初步筛选出一些对AS有潜在治疗作用的中药有效成分,为进一步研究提供了新的思路和参考.

关键词

脊柱炎,强直性/计算生物学/中草药/槲皮素/汉黄芩素/漆黄素/有效成分

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基金项目

河北省中医药管理局科研计划(2014207)

出版年

2022
解放军医药杂志
北京军区医学科学技术委员会

解放军医药杂志

影响因子:1.264
ISSN:2095-140X
被引量4
参考文献量4
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