解放军医药杂志2022,Vol.34Issue(9) :50-54.DOI:10.3969/j.issn.2095-140X.2022.09.011

基于生物信息学分析骨质疏松症与炎症性肠病的相关性

Correlation between Osteoporosis and Inflammatory Bowel Disease Based on Bioinformatics

常裕绅 张子鸣 李振宇 安娟 何瀚威 匡建军
解放军医药杂志2022,Vol.34Issue(9) :50-54.DOI:10.3969/j.issn.2095-140X.2022.09.011

基于生物信息学分析骨质疏松症与炎症性肠病的相关性

Correlation between Osteoporosis and Inflammatory Bowel Disease Based on Bioinformatics

常裕绅 1张子鸣 2李振宇 2安娟 2何瀚威 2匡建军3
扫码查看

作者信息

  • 1. 410208 长沙,湖南中医药大学研究生院;410006 长沙,湖南省中医药研究院
  • 2. 410208 长沙,湖南中医药大学研究生院
  • 3. 410006 长沙,湖南省中医药研究院
  • 折叠

摘要

目的 通过生物信息学策略探讨骨质疏松症(OP)与炎症性肠病(IBD)间的基因相关性.方法 分别以"osteoporosis"及"Inflammatory bowel disease"为关键词从网络疾病数据库(DisGeNET、TTD、OMIM、GeneCards)中遴选相关基因,去重后将两组靶基因进行映射得到交集靶点并使用R软件进行GO功能及KEGG通路富集分析,通过string网站分析得到蛋白相互作用网络图,通过cytoHubba插件中的MCC算法筛选出关键靶点,借助网络分析工具Networkanalyst预测关联miRNA并绘制网络图.结果 获得OP和IBD相关靶点分别为1779和2779个,获得交集靶点869个,R软件富集得到4278项GO功能富集结果及173条KEGG信号通路,共筛选到10个关键靶点.结论 IL6、IL10、IL17A、TNF、CSF2、IL4、IL1B、CXCL8、IFNG、IL13作用的炎症通路的激活可能是OP与IBD的共同病因,miR-98-5p、miR-335-5p、miR-24-3p和miR-106a-5p可能作为治疗IBD和OP的新手段.

关键词

骨质疏松症/炎症性肠病/白细胞介素6/白细胞介素10/肿瘤坏死因子类/非编码单链RNA

引用本文复制引用

基金项目

出版年

2022
解放军医药杂志
北京军区医学科学技术委员会

解放军医药杂志

影响因子:1.264
ISSN:2095-140X
参考文献量1
段落导航相关论文