首页|奶牛黏膜病的BVDV HJ-1株全基因组序列分析

奶牛黏膜病的BVDV HJ-1株全基因组序列分析

扫码查看
原文链接
  • 国家科技期刊平台
  • NETL
  • NSTL
  • 万方数据
  • 维普
BVDV HJ-1分离株属于1b基因亚型是引起奶牛发生黏膜病和出血综合症病原,导致高病死率.为了解BVDV HJ-1株的遗传学特征,研究应用PCR方法分13段扩增其全基因组序列,通过克隆测序最终组装出全序列.应用生物信息学软件对BVDV HJ-1基因序列同源性、跨膜结构域、糖基化位点、5'UTR一级结构与二级结构的差异等进行分析.结果测得该毒株全序列为12282 nt,与参考毒株相比存在高度变异,序列同源性在70.1％～93.5％,尤其是非结构蛋白NS4A、NS4B和NS5A同源性在49.0％～93.0％.E1-E2存在5个潜在的跨膜信号区,结构蛋白上富含14个潜在的糖基化位点,5'UTR I区和Ⅲb-Ⅲe区相对保守,不同毒株之间II区的二级结构变异大.总之,BVDV HJ-1株全基因组序列信息丰富了我国BVDV的遗传学数据资源,为下一步疫苗的研制和致病机理的研究奠定了基础.
Complete Genome Sequence Analysis of BVDV HJ-1 Strains from Mucosal Disease in Dairy Cows

邵红、张林雁、夏立勇、佟海山、李旭阳、周玉龙、张旭

展开 >

黑龙江八一农垦大学动物科技学院,大庆 163319

黑龙江八一农垦大学人文学院

黑龙江省东宁市畜牧兽医服务总站

杜尔伯特蒙古族自治县畜牧技术服务中心

展开 >

黏膜病 牛病毒性腹泻病毒 全序列 生物信息

ZRCPY201807C2017051ZY18C07

2021

10.3969/j.issn.1002-2090.2021.04.004

黑龙江八一农垦大学学报
黑龙江八一农垦大学

黑龙江八一农垦大学学报

影响因子：0.888
ISSN：1002-2090
年,卷(期)：2021.33(4)
  • 2
  • 4