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牛坏死杆菌43K OMP的生物信息学分析及B细胞表位预测

Bioinformatics Analysis and B Cell Epitope Prediction of 43K OMP from Bovine Fusobacterium Necrophrum

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为了对牛坏死杆菌43K OMP进行生物信息学分析,并预测其B细胞表位,研究利用Prot Param在线软件、TMHMM在线软件、Net Phos软件、DNA star软件和I-TASSER在线软件,分别对43K OMP的理化性质、跨膜区、磷酸化位点、二级结构和三级结构进行分析,用Bepipred在线软件和Ellipro在线软件对其B细胞表位进行预测,并对预测的表位肽进行验证.结果表明43K OMP共编码377个氨基酸,相对分子质量为42.927×103,理论等电点为8.74,该蛋白在1-20aa处存在信号肽区域,无跨膜区,包括34个磷酸化位点,具有10个构象B细胞表位,多个线性B细胞表位,合成的4表位肽经ELISA验证显示反应性良好.通过生物信息学技术分析出43K OMP的性质及结构,预测出其具有多个B细胞表位,为该蛋白的功能研究及基因工程疫苗的研制提供依据.

王丽娜、贺显晶、蒋剑成、汪锋锋、肖佳薇、蒋凯、赵鹏宇、王天硕、于思雯、毕栏、郭东华

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黑龙江八一农垦大学动物科技学院,大庆 163319

牛坏死杆菌 43K OMP 生物信息学分析 B细胞表位

黑龙江八一农垦大学校内培育课题

XA2016-03

2022

10.3969/j.issn.1002-2090.2022.03.007

黑龙江八一农垦大学学报
黑龙江八一农垦大学

黑龙江八一农垦大学学报

影响因子：0.888
ISSN：1002-2090
年,卷(期)：2022.34(3)
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