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奶牛乳房炎主要病原菌GapC蛋白生物信息学分析及抗原表位预测

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奶牛乳腺炎是主要由病原菌感染引起的奶牛常见疾病,新型疫苗研发是防控奶牛乳腺炎的重要内容之一.引起奶牛乳腺炎的主要病原菌为链球菌和葡萄球菌,包括无乳链球菌、停乳链球菌、乳房链球菌、金黄色葡萄球菌和表皮葡萄球菌,它们都存在甘油醛-3-磷酸脱氢酶C(GapC),且均能诱导机体产生良好的抗感染免疫保护作用.但对链球菌和葡萄球菌GapC的交叉免疫原性分析和研究缺乏报道.研究从GenBank获取链球菌和葡萄球菌GapC基因序列,利用生物信息学软件对理化性质、同源性、T细胞和B细胞表位等进行分析.结果显示,这些病原菌GapC均由 336 个氨基酸组成的亲水性蛋白,且无规则卷曲占比较高,表明具有良好的抗原性;三种链球菌与两种葡萄球菌之间GapC的氨基酸序列同源性 67.8%～69.9%,存在 4 个共同线性B细胞表位、9个共同CD4+T细胞表位和 9个共同CD8+T细胞表位,表明有一定的交叉免疫原性,为进一步实验研究GapC交叉免疫原性提供重要参考.
Bioinformatics Analysis and Epitopes Prediction of GapC from the Main Pathogenic Bacteria Causing Cow Mastitis

刘慧婷、刘学静、宋成祺、陈晶、张帆、高珊、佟春玉、马金柱、崔玉东

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黑龙江八一农垦大学动物科技学院,大庆 163319

黑龙江八一农垦大学生命科学技术学院

奶牛乳腺炎 无乳链球菌 金黄色葡萄球菌 甘油醛-3-磷酸脱氢酶C 生物信息学分析 交叉免疫原性

黑龙江省自然科学基金黑龙江八一农垦大学科研处"三横三纵"团队项目

ZD2016004TDJH201810

2023

10.3969/j.issn.1002-2090.2023.03.006

黑龙江八一农垦大学学报
黑龙江八一农垦大学

黑龙江八一农垦大学学报

影响因子：0.888
ISSN：1002-2090
年,卷(期)：2023.35(3)
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