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玉米GATA基因家族的全基因组鉴定及热胁迫下的表达分析

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利用生物信息学方法对玉米基因组中的GATA基因家族成员进行鉴定,并对其理化性质、染色体分布、系统进化、基因结构、保守基序进行分析,并分析其在热胁迫前后的表达水平变化,以期为玉米GATA基因功能研究奠定基础.结果表明,在玉米基因组中共鉴定到37个GATA基因,它们不均匀地分布在10条染色体上,均含有CX2 CX18 CX2 C保守基序;进化树分析表明,玉米GATA基因家族可分为A、B、C、D 4组,分别包含21、10、4、2个基因,同一组内的基因具有相似的基因结构.热胁迫处理后,玉米GATA家族成员中表达上调的基因有9个,包含A组5个(Zm00001d010785、Zm00001d023539、Zm00001d041883、Zm00001d025953、Zm00001d031135),B组2个(Zm00001d011771、Zm00001d034751),C组2个(Zm00001d036494、Zm00001d014656);下调的基因有2个,均属于B组(Zm00001d016361和Zm00001d009193).说明上调表达的这9个GATA基因在应答热胁迫过程中可能发挥重要作用.
Genome-Wide Identification of Maize GATA Gene Family and Expression Analysis under Heat Stress

王延召、周波、韩小花、黄保、鲁晓民、程军玲、王淑凤、聂利红

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河南省农业科学院 粮食作物研究所,河南 郑州 450002

禹州市农业农村局,河南 禹州 451670

河南省农业科学院 经济作物研究所,河南 郑州 450002

玉米 GATA基因家族 全基因组鉴定 热胁迫 基因表达

河南省农业科学院重大科技成果培育计划项目

2020

10.15933/j.cnki.1004-3268.2020.11.003

河南农业科学
河南省农业科学院

河南农业科学

CSTPCD北大核心
影响因子：0.787
ISSN：1004-3268
年,卷(期)：2020.49(11)
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