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干旱胁迫下野生大豆ABC转运蛋白转录组测序分析

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为获取干旱胁迫状态下ABC转运蛋白家族相关基因,以抗旱性强的野生大豆为试验材料,浇灌20％PEG 6000模拟干旱胁迫,分别在干旱处理0、6、12、24和48 h后取叶片提取RNA进行转录组测序;以GO、KEGG和NR三大数据库注释的结果为基础,再以ABC转运蛋白为关键词进行筛选.结果 表明,共获得337条ABC转运蛋白相关序列,包括8大亚家族(ABCA、ABCB、ABCC、ABCD、ABCE、ABCF、ABCG和ABCI).差异表达分析结果表明,共有182条表现差异表达.GO注释到的差异表达基因多数为嘌呤核苷酸分解过程,KEGG注释到的差异表达基因分布在5个亚家族(ABCA、ABCB、ABCC、ABCD和ABCG).对NR数据库有注释的168条差异表达基因进行进化分析,结果表明ABCE、ABCF、ABCG家族与ABCI11为一类,ABCB、ABCC家族与ABCI10为一类,ABCA、ABCD家族与ABCI19为一类.本研究为进一步研究野生大豆干旱胁迫下ABC转运蛋白抗旱基因提供了一定的理论依据.
Sequence Analysis of ABC Transporter Transcriptome in Wild Soybean Under the Drought Stress

张小芳、乔亚科、王冰冰、徐燕、张锴、李桂兰

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河北科技师范学院农学与生物科技学院,河北秦皇岛 066600

野生大豆 转录组测序 干旱胁迫 ABC转运蛋白

河北省自然科学基金河北省研究生创新资助项目现代农业产业技术体系河北省创新团队建设项目

C2016407100CXZZSS2018148HBCT2018090203

2019

核农学报
中国原子能农学会 中国农业科学院农产品加工研究所（前中国农业科学院原子能利用研究所）

核农学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：1.5
ISSN：1000-8551
年,卷(期)：2019.33(8)
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