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基于不同颜色山楂花MYB家族的挖掘与比较分析

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为了研究MYB转录因子家族对山楂花色的影响,明确MYB转录因子在花色芽变品种中的表达情况,采用MYB蛋白质理化性质分析、motif结构预测、基因进化树分析以及基因表达量分析等方法对转录组数据进行深度挖掘.结果表明,共筛选出73个MYB转录因子,其中35个1R-MYB成员、36个2R-MYB成员、2个3R-MYB成员.1R-MYB蛋白序列的长度在50～786个氨基酸之间,2R-MYB蛋白序列长度在88～979个氨基酸之间,且仅有3个MYB基因家族蛋白为稳定蛋白.以拟南芥2R-MYB蛋白为参考进行系统进化树分析,19个山楂2R-MYB蛋白被分入14个已有一定研究基础的亚组中;1R-MYB蛋白进行单独分析,被分为6个亚组.通过差异表达分析,发现8个可能调控山楂花色的MYB转录因子.本研究结果为进一步研究影响山楂花色的MYB转录因子提供了一定的参考数据.
Excavation and Comparative Analysis of MYB Family Based on Hawthorn Flowers With Different Colors

李戌彦、杨忠义、纪薇、杨明霞

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山西农业大学园艺学院,山西太谷030801

农业部黄土高原作物基因资源与种质创制重点实验室,山西太原030031

果树种质创制和利用山西省重点实验室,山西太原030031

山西农业大学果树研究所,山西太谷030801

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山楂 MYB转录因子 转录组 花色

山西省农业科学院博士基金山西省重点研发计划-中药现代化振东专项基金研究山西省农业科学院生物育种工程

YBSJJ18102016ZD010917yzgc041

2021

10.11869/j.issn.100-8551.2021.01.0049

核农学报
中国原子能农学会 中国农业科学院农产品加工研究所（前中国农业科学院原子能利用研究所）

核农学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：1.5
ISSN：1000-8551
年,卷(期)：2021.35(1)
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