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基于RNA-seq的谷子萌芽期抗旱相关基因挖掘与分析

Identification and Analysis of Drought Related Genes in Foxtail Millet (Setaria italica L.) at Germination Stage Based on Transcriptome Sequencing

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为了明确响应干旱胁迫的关键基因,解析谷子抗旱机制,本研究以谷子抗旱品种山西2010和干旱敏感品种K359*M4-1为材料,应用RNA-seq技术对两个品种干旱胁迫前后萌发期种子进行转录组测定.结果 表明,在山西2010和K359*M4-1中分别鉴定出2300个和3652个差异表达基因(DEG),包括编码类锌诱导的促进因子、类萌发素蛋白、蛋白磷酸化酶、转运蛋白、胚胎发育晚期丰富蛋白(LEA)、转录因子、过氧化物酶等基因.通过对鉴定到的DEG进行GO和KEGG代谢途径富集分析,发现山西2010和K359*M4-1中的DEG分别富集在52个和21个生物学过程.KEGG富集分析发现,DEG主要富集在淀粉和蔗糖代谢,植物激素信号转导,光合作用-天线蛋白,苯丙素生物合成,角质、亚氨酸和蜡生物合成,次生代谢物生物合成等途径.本研究结果为挖掘谷子抗旱关键基因、解析谷子抗旱机制奠定了基础.

代小冬、朱灿灿、宋迎辉、王春义、代书桃、秦娜、李君霞

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河南省农业科学院粮食作物研究所,河南郑州450002

谷子 萌芽期 抗旱性 RNA-seq

U1504314Nycytx-CARS-06

2021

10.11869/j.issn.100-8551.2021.08.1761

核农学报
中国原子能农学会 中国农业科学院农产品加工研究所（前中国农业科学院原子能利用研究所）

核农学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：1.5
ISSN：1000-8551
年,卷(期)：2021.35(8)
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