肿瘤基础与临床2024,Vol.37Issue(4) :377-380.DOI:10.3969/j.issn.1673-5412.2024.04.002

综合生物信息学分析紧密连接蛋白-11在乳腺癌中的作用

Comprehensive bioinformatics analysis of the role of claudin-11 in breast cancer

杨广达 剪柳萌 陈倩雅
肿瘤基础与临床2024,Vol.37Issue(4) :377-380.DOI:10.3969/j.issn.1673-5412.2024.04.002

综合生物信息学分析紧密连接蛋白-11在乳腺癌中的作用

Comprehensive bioinformatics analysis of the role of claudin-11 in breast cancer

杨广达 1剪柳萌 2陈倩雅1
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作者信息

  • 1. 广州医科大学附属第四医院肿瘤科,广东 广州 511300
  • 2. 广州医科大学附属第四医院老年病科/神经内科,广东 广州 511300
  • 折叠

摘要

目的 研究紧密连接蛋白-11(CLDN11)在乳腺癌中的表达水平及生存预后价值.方法 首先使用UALCAN和KM-plotter数据库分析CLDN11 在乳腺癌中的 mRNA水平,然后分析其生存预后价值,最后使用 bc-GenExMiner v4.5 数据库分析CLDN11 在不同临床参数乳腺癌中的表达水平.结果 与正常组织比较,CLDN11 mRNA水平在乳腺癌中呈低表达(UALCAN数据库:P<0.001;KM-plotter数据库:P<0.001).生存预后分析结果表明,低表达水平的CLDN11 在乳腺癌中与更差的总生存期[UALCAN数据库:P=0.037;KM-plotter数据库:HR=0.58(0.42~0.80),Log-rank P<0.001]和疾病无进展生存期[KM-plotter数据库:HR=0.66(0.57~0.77),Log-rank P<0.001]相关.CLDN11 mRNA水平与不同年龄(P<0.001)、ER状态(P<0.001)、PR状态(P<0.001)、HER2状态(P<0.000 1)、三阴型乳腺癌(TNBC)亚型(P=0.001)以及基底样及TNBC亚型(P<0.001)相关.结论 CLDN11 在乳腺癌中低表达,并且可以作为预后指标,但是其分子作用机制仍需要更多的实验研究证实.

Abstract

Objective To investigate the expression level of claudin-11(CLDN11)in breast cancer and its prog-nostic value.Methods The mRNA levels of CLDN11 in breast cancer were analyzed using UALCAN and KM-Plotter data-bases.Secondly,its prognostic value was also analyzed.Finally,bc-GenExMiner V4.5 database was used to analyze the expression level of CLDN11 in breast cancer with different clinical parameters.Results CLDN11 mRNA levels were down-regulated in breast cancer compared to normal tissue(UALCAN database:P<0.001;KM-plotter database:P<0.001).Survival prognostic analysis showed that low expression of CLDN11 was associated with poorer overall survival[UALCAN database:P=0.037;KM-plotter database:HR=0.58(0.42~0.80),Log-rank P<0.001]and progression free survival[KM-plotter database:HR=0.66(0.57~0.77),Log-rank P<0.001]in breast cancer.CLDN11 mRNA level was correla-ted with different age(P<0.001),ER status(P<0.001),PR status(P<0.001),HER2 status(P<0.001),triple negative breast cancer(TNBC)subtype(P=0.001)and basal like TNBC subtype(P<0.001).Conclusion CLDN11 was down-regulated in breast cancer and can be used as a prognostic indicator.However,more experimental studies are needed to confirm the molecular mechanism.

关键词

乳腺癌/紧密连接蛋白-11/生物信息学/无进展生存期/总生存期/预后指标

Key words

breast cancer/claudin-11/bioinformatics/progression free survival/overall survival/prognostic marker

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基金项目

广州市增城区科技计划项目-民生科技项目(ZCKJ2019-008)

出版年

2024
肿瘤基础与临床
河南省抗癌协会,郑州大学,河南省肿瘤医院,河南省肿瘤研究所

肿瘤基础与临床

影响因子:0.861
ISSN:1673-5412
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