摘要
背景转录相关酸性卷曲蛋白3 (transforming acidic coiled coil protein 3,TACC3)是TACC家族的重要成员,研究表明,TA CC基因在乳腺癌,非小细胞肺癌,胃癌中高表达,并与预后较差有关.但是其在肝癌中的表达情况及与患者预后的关系鲜见报道.目的 通过生物信息学手段探讨TA CC3基因在肝癌中的表达及其与患者的预后关系,方法分别检索BioGPS、Oncomine、癌症细胞系百科全书(cancer cell line encyclopedia,CCLE)数据库,挖掘分析TA CC3基因在正常人体组织、肝癌组织及肝癌细胞系中的表达情况,应用Kaplan-Meier Plotter、GEPIA等数据库分析TA CC3基因对肝癌患者预后的影响.结果 BioGPS数据库分析结果显示TA CC3基因在人体各组织中均有表达,肝脏组织中的表达值中位数略高于其他正常组织(8.95 vs 7.1).从Oncomine数据库检索出TACC3基因相关研究290项,显示肝癌组织中TACC3基因高表达4项,低表达1项,Meta分析显示与正常肝组织相比TACC3基因在肝癌组织中呈高表达状态[中位秩(Median Rank)=442.5,P＜0.05].CCLE数据库分析显示,在肝癌细胞系中TACC3 mRNA高表达.Kaplan-Meier Plotter及GEPIA数据库生存分析结果显示,TACC3基因高表达组的肝癌患者总体生存时间(OS)和无进展生存时间(PFS)等生存预后指标均较低表达组差(P＜0.05).结论 TACC3基因在肝癌组织中呈高表达,且TACC3基因高表达与肝癌患者生存预后差有关.
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