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基于生物信息学分析DE2A基因在消化系统肿瘤预后及免疫浸润的临床意义

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背景 消化系统肿瘤是最常见的恶性肿瘤之一,然而其预后仍不好.探索潜在生物标志物是肿瘤研究的重要方向.我们拟利用生物信息学方法探索消化系统的潜在标志物.目的 探究在消化系统肿瘤中PDE2A表达与免疫浸润相关性,探索PDE2A在消化系统肿瘤中的预后价值.方法 通过HPA、TIMER和UALCAN数据库分析PDE2A在不同消化系统肿瘤中的mRNA及蛋白表达,利用GEPIA数据库探索PDE2A在不同消化系统肿瘤患者预后的影响.通过TIMER数据库探索PDE2A表达与不同消化系统肿瘤免疫浸润相关性.利用cBioPortal数据库分析PDE2A在不同消化系统肿瘤的遗传突变信息.通过STRING数据库探索PDE2A的潜在蛋白相互作用网络.结果 PDE2A基因mRNA和蛋白在肝癌、胃癌、胰腺癌、结肠癌和食管癌组织中表达低于正常癌旁组织.PDE2A高表达的肝癌和胰腺癌患者较PDE2A低表达的患者预后良好.PDE2A表达与肝癌、胃癌、胰腺癌、结肠癌和食管癌不同免疫细胞如CD4+T淋巴细胞、CD8+T淋巴细胞、B细胞、巨噬细胞和中性粒细胞呈正相关或负相关.PDE2A基因在胃癌、胰腺癌、结肠癌及食管癌中存在错义突变等遗传改变.结论 PDE2A表达与消化系统肿瘤免疫浸润有关.PDE2A高表达的肝癌和胰腺癌患者预后良好.PDE2A基因可能为潜在的消化系统肿瘤免疫治疗靶点和预后标志物.
Clinical significance of PDE2A in prognosis and immune infiltration in gastrointestinal cancer based on bioinformatics analysis

张钊熊、韩强、刘树业

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天津市第三中心医院检验科,天津市重症疾病体外生命支持重点实验室,天津市人工细胞工程技术研究中心,天津市肝胆疾病研究所 天津市300170

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消化系统肿瘤 免疫浸润 预后 PDE2A 生物信息学

国家自然科学基金,

81902986

2021

10.11569/wcjd.v29.i18.1055

世界华人消化杂志
太原消化病研治中心

世界华人消化杂志

影响因子：1.023
ISSN：1009-3079
年,卷(期)：2021.29(18)
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