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辣椒WOX基因家族的鉴定及表达分析

Identification and analysis of WOX gene family in pepper

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利用辣椒的全基因组数据从辣椒中鉴定出了 10 个WOX基因,并按照其在染色体上的分布顺序命名为CaWOX1、CaWOX2、CaWOX3、…、CaWOX10,对它们的理化性质、染色体定位、与番茄的进化关系、蛋白保守基序、组织表达水平及在高温(42℃)、低温(10℃)胁迫下的表达水平进行分析.结果表明:辣椒WOX基因家族各成员的理化性质差异较大,10个家族成员编码的氨基酸长度为127～318 aa,蛋白相对分子质量为14740～36070,开放阅读框长度为 384～957 bp,蛋白理论等电点(PI)为 5.66～10.01;在染色体上的分布较为均匀,大部分分布在染色体的两端;系统进化树分析表明,辣椒WOX基因家族可分为现代、中间、古代 3支,与番茄进化关系一致;蛋白保守基序显示,除CaWOX3 外,其余蛋白都含有Motif1 与Motif2,且二者总是紧密相连出现;组织表达水平分析表明,除了部分CaWOXs具有特异性表达模式外,大部分成员在组织中不表达或弱表达;高温、低温处理能够刺激或抑制WOX基因家族成员的表达.

李秀敏、董轩、汤冰倩、杨慧萍、陈莹、熊程、邹学校、刘峰

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湖南大学生物学院隆平分院,湖南 长沙 410125

湖南农业大学园艺学院,湖南 长沙 410128

园艺作物种质创新与新品种选育教育部工程研究中心,湖南 长沙 410128

蔬菜生物学湖南省重点实验室,湖南 长沙410128

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辣椒 WOX基因家族 生物信息学 基因表达

国家重点研发计划项目湖南省教育厅项目中国博士后基金湖南省教育厅重点项目

2019YFD100030019B2712021M70117720A259

2023

10.13331/j.cnki.jhau.2023.03.006

湖南农业大学学报(自然科学版)
湖南农业大学

湖南农业大学学报(自然科学版)

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：0.868
ISSN：1007-1032
年,卷(期)：2023.49(3)
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