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亚成体与老年体圈养大熊猫的口腔菌群多样性及潜在致病菌分析

Analysis of the oral microflora diversity and potential pathogenic bacteria of sub-adult and elderly captive giant pandas

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采用高通量测序技术对 6只亚成体和老年体的圈养大熊猫口腔唾液样本进行测序,分析圈养大熊猫口腔细菌的菌群多样性、结构和潜在致病菌及其在 2组不同年龄群体间的差异.结果显示:大熊猫口腔中的细菌以变形菌门(Proteobacteria)和蓝细菌门(Cyanobacteria)等为主,相对丰度分别为 70.4%、13.4%,在属水平上主要有放线杆菌属(Actinobacillus)、劳特罗普氏菌属(Lautropia)、假单胞菌属(Pseudomonas)和莫拉氏菌属(Moraxella)等,相对丰度分别为 10.5%、5.4%、3.9%、3.8%;亚成体大熊猫口腔菌群的多样性和丰富度高于老年体的,但差异无统计学意义;β多样性分析结果显示,2组大熊猫口腔菌群结构间的差异无统计学意义;LEfSe分析发现 2组之间的差异细菌在亚成体组中有Niveispirillum、固氮螺菌属(Azospirillum)与根瘤菌属(Rhizobium),在老年体组中则有气单胞菌属(Arenimonas)和二氧化碳噬纤维菌属(Capnocytophaga),但它们的相对丰度均不高;圈养大熊猫口腔中有链球菌属(Streptococcus)、放线菌属(Actinomyces)、卟啉单胞菌属(Porphyromonas)和葡萄球菌属(Staphylococcus)等致病菌,其中与龋齿相关的菌群相对丰度较高,这可能与圈养大熊猫摄入了较多的碳水化合物有关.

王承东、李根、姜尧章、杨超、李德生、何鸣、凌珊珊、古玉、马晓平

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中国大熊猫保护研究中心,四川 都江堰 611800

四川农业大学动物医学院,四川 成都 611130

湖北三峡职业技术学院农学院,湖北 宜昌 443000

四川水利职业技术学院生物工程学院,四川 成都 611231

四川农业大学生命科学学院,四川 成都 611130

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大熊猫 圈养 口腔菌群 潜在致病菌 高通量测序

国家林业和草原局大熊猫国际资金项目

GH201708

2023

10.13331/j.cnki.jhau.2023.03.015

湖南农业大学学报(自然科学版)
湖南农业大学

湖南农业大学学报(自然科学版)

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：0.868
ISSN：1007-1032
年,卷(期)：2023.49(3)
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